17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0950 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0950  amidohydrolase 2  100 
 
 		 289 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0320678 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1240  amidohydrolase 2  35.46 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1786  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 279 aa  149  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5795  amidohydrolase 2  33.46 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0242  amidohydrolase 2  30.03 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2755  amidohydrolase 2  29.89 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.176461  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  26.25 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1692  amidohydrolase 2  25.3 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4176  amidohydrolase 2  25.23 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3747  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3669  hypothetical protein  25.62 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43740  hypothetical protein  25.62 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3499  amidohydrolase 2  23.62 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2482  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235621  normal  0.340948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4097  amidohydrolase 2  30.71 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1464  hypothetical protein  26.12 
 
 		 390 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3071  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 387 aa  42.7  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0618918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>