17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5795 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5795  amidohydrolase 2  100 
 
 		 319 aa  650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0242  amidohydrolase 2  66.56 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2755  amidohydrolase 2  53.23 
 
 		 284 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.176461  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1240  amidohydrolase 2  38.49 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1786  amidohydrolase 2  31.09 
 
 		 279 aa  146  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0950  amidohydrolase 2  33.46 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.447274  normal  0.0320678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4176  amidohydrolase 2  34.68 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3747  amidohydrolase 2  32.31 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43740  hypothetical protein  32.31 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2482  amidohydrolase 2  31.31 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.235621  normal  0.340948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4097  amidohydrolase 2  26.12 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1692  amidohydrolase 2  32.31 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.104214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3669  hypothetical protein  31.79 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.846184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1629  amidohydrolase 2  29.65 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3499  amidohydrolase 2  31.21 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.747676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3843  amidohydrolase 2  24.5 
 
 		 390 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2056  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00516688  hitchhiker  0.00129345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>