12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2056 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2056  amidohydrolase 2  100 
 
 		 285 aa  586  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00516688  hitchhiker  0.00129345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1458  amidohydrolase 2  51.99 
 
 		 302 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0124476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2795  amidohydrolase 2  51.99 
 
 		 302 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.473987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0242  amidohydrolase 2  29.45 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2755  amidohydrolase 2  27.48 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.176461  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5795  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  27.63 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  29.17 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3071  amidohydrolase 2  28.43 
 
 		 387 aa  42.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01860  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  40.38 
 
 		 363 aa  42.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4869  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 330 aa  42.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  24.37 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>