62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0596 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  100 
 
 
279 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  28.78 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  30.74 
 
 
309 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  28.17 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  27.46 
 
 
301 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  27.21 
 
 
358 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  28.32 
 
 
297 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  27.96 
 
 
297 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  26.41 
 
 
308 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  26.47 
 
 
385 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  26.47 
 
 
341 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  26.3 
 
 
341 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  26.47 
 
 
341 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  27.02 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  27.14 
 
 
308 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
311 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  27.82 
 
 
285 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  26.57 
 
 
884 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.59 
 
 
289 aa  99.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  25.36 
 
 
271 aa  95.5  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  25 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  23.86 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  22.5 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  22.92 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  22.7 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  22.66 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  27.94 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  21.25 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  23.23 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  25 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  23.77 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  22.07 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
255 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  21.48 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  26.09 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  20.54 
 
 
289 aa  48.9  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  20.9 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  21.59 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  21.29 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  20.88 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  24.18 
 
 
312 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  17.73 
 
 
285 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  22.47 
 
 
261 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  21.43 
 
 
273 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  23.2 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2056  amidohydrolase 2  29.17 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00516688  hitchhiker  0.00129345 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  21.28 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2032  amidohydrolase 2  23.58 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  22.46 
 
 
350 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  22.53 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  27.31 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  23.23 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  21.36 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  22.1 
 
 
218 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  23.86 
 
 
316 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
336 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
336 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  23.02 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  21.64 
 
 
294 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>