88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4683 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  100 
 
 
268 aa  524  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
301 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  33.7 
 
 
308 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  32.37 
 
 
308 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  34.16 
 
 
884 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  33.45 
 
 
358 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  34.4 
 
 
297 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  34.04 
 
 
296 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  33.72 
 
 
311 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  33.1 
 
 
297 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  34.18 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  33.69 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  34.41 
 
 
289 aa  95.1  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  33.81 
 
 
333 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  26.64 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  26.64 
 
 
385 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  26.64 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  30.1 
 
 
341 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  27.69 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  23.05 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  30.04 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  28.25 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  28.02 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  27.62 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  29.78 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  28.64 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.71 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  28.82 
 
 
279 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
298 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  25.73 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  24.82 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  25.73 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  28.14 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  31.46 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  23.37 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  27.07 
 
 
297 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  23.42 
 
 
264 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  24.23 
 
 
310 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  26.6 
 
 
278 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  24.9 
 
 
304 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  27.54 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.44 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  30.66 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  24.84 
 
 
293 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  27.2 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  23.16 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  28.67 
 
 
294 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1562  amidohydrolase 2  27.49 
 
 
285 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  29.73 
 
 
300 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.18 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  25.75 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  22.89 
 
 
244 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
291 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  26.47 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  29.85 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  25.21 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  25.41 
 
 
289 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  28.08 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  25.97 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
299 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  30 
 
 
287 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  28.41 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  31.19 
 
 
287 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  30.49 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  26.95 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  28.44 
 
 
305 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
252 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  22.07 
 
 
269 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  24.31 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  24.44 
 
 
289 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4473  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
276 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  26.82 
 
 
293 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  29.94 
 
 
392 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  24.89 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  28.34 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  25 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  25.81 
 
 
391 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  22.12 
 
 
345 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  27.98 
 
 
255 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  20 
 
 
294 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  32.28 
 
 
293 aa  42.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  27.44 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  25.87 
 
 
278 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  28.81 
 
 
291 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2701  amidohydrolase 2  24.52 
 
 
291 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>