161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4981 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  100 
 
 		 278 aa  567  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  63.67 
 
 		 278 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  66.67 
 
 		 282 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  64.75 
 
 		 278 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  61.35 
 
 		 282 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  49.47 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  37.59 
 
 		 288 aa  168  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  32.53 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  34.75 
 
 		 285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  33.69 
 
 		 280 aa  145  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  30.47 
 
 		 274 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  29.15 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  31.12 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  28.78 
 
 		 278 aa  132  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  31.1 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  32.16 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  33.04 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  31.56 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  29.68 
 
 		 275 aa  125  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  32.43 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  27.96 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  29.33 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  30.74 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  27.7 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  30.54 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  32.95 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  29.39 
 
 		 297 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  29.73 
 
 		 297 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  31.35 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  31.68 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  29.23 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  29.24 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  31.35 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  31.35 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  30.39 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  33.88 
 
 		 285 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  30.32 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  30.39 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  29.58 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  29.43 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  31.82 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  29.45 
 
 		 290 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  27.57 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  27.21 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  28.23 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  32.05 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  31.69 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  28.67 
 
 		 278 aa  99  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  27.3 
 
 		 287 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1174  hypothetical protein  26.5 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.021087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  28.48 
 
 		 314 aa  96.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  31.87 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  31.87 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  31.87 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  31.87 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  29.55 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  31.87 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  32.57 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  31.47 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  27.59 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  29.71 
 
 		 290 aa  88.6  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  33.52 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  29.1 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  32.92 
 
 		 290 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  25 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  28.18 
 
 		 296 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  28.18 
 
 		 296 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  29.59 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  27.99 
 
 		 310 aa  85.5  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  28.74 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  31.35 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  26.62 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  29.9 
 
 		 378 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  31.35 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  31.35 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  32.69 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09180  Amidohydrolase 2  28.32 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  30.86 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  27.34 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  28.36 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  26.42 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  25.26 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  24.75 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  31.11 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  30 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  31.03 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  27.48 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  27.49 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  30.15 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>