51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6430 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  100 
 
 
309 aa  619  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  65.74 
 
 
297 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  66.09 
 
 
297 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  59.45 
 
 
296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  54.88 
 
 
884 aa  317  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  54.33 
 
 
308 aa  314  9e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  58.6 
 
 
285 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  53.61 
 
 
333 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  51.96 
 
 
311 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  49.83 
 
 
301 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  52.08 
 
 
358 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  53.61 
 
 
308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  50.34 
 
 
297 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  49.83 
 
 
289 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  30.74 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  29.17 
 
 
341 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  28.98 
 
 
341 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  28.98 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  28.98 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  28.65 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  28.83 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  28.46 
 
 
268 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  21.79 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  20.34 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  26.55 
 
 
293 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  30.14 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  30.3 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  27.69 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  28.96 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  31.72 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  28.42 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  28.42 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  27.08 
 
 
286 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  24.77 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  29.92 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  29.1 
 
 
392 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  23.76 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  25.6 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
304 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  29.07 
 
 
279 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  25.78 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  30.37 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3277  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  24.42 
 
 
218 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  25.18 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  29.05 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.58 
 
 
293 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  28.99 
 
 
287 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  25.9 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  28.97 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>