82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1273 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  100 
 
 		 308 aa  618  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  56.57 
 
 		 308 aa  335  5.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  57.88 
 
 		 296 aa  318  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  58.16 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  55.78 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  57.48 
 
 		 297 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  54.03 
 
 		 297 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  52.94 
 
 		 311 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  56.74 
 
 		 285 aa  289  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  52.58 
 
 		 358 aa  285  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  53.61 
 
 		 309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  52.16 
 
 		 884 aa  281  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  50 
 
 		 301 aa  275  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  46.76 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  31.7 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  30.62 
 
 		 385 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  30.62 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  27.14 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  30.62 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  30.29 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  34.18 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  22.49 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  26.82 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  32.45 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.91 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  30.68 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  25.88 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  25.61 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  25.73 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  25.21 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  22.58 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  33.58 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  22.64 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  30.23 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  28.06 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  34.95 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  24.73 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  26.04 
 
 		 269 aa  53.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  25.32 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  23.91 
 
 		 297 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  28.33 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  28.26 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  35.92 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  28.04 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  23.32 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 387 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25.58 
 
 		 289 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  31.71 
 
 		 303 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  24.62 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  25.58 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27.34 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  25.7 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  25 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  24.42 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  25.44 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  31.53 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  25.44 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  28.8 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  27.67 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  26.81 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  22.76 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  33.68 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  26.62 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  26.49 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  21.15 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  28.08 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  24.31 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  27.21 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  28.68 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  27.5 
 
 		 278 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>