94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1073 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  100 
 
 		 275 aa  551  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  32.92 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  25.82 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  30.95 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  25.57 
 
 		 305 aa  72  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.93 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  30 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  33.52 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  30.92 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1795  amidohydrolase 2  28.02 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000138778  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  22.54 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  29.34 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  25.89 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  26.59 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  24.53 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 884 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  27.23 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  32.8 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  24.19 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1919  amidohydrolase 2  31.06 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.414859  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  30.94 
 
 		 338 aa  58.9  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  29.52 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  32.8 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  30.48 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  27 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  24.32 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  32.37 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0340  amidohydrolase 2  31.53 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  29.44 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  27.62 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.12 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  24.24 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  27.14 
 
 		 387 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4067  amidohydrolase 2  28.66 
 
 		 373 aa  52.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.186813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0865  amidohydrolase 2  25.66 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  27.16 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  24.18 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 358 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.86 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  25.24 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12326  antibiotic-resistance protein  25.45 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  26.19 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1841  amidohydrolase 2  31.8 
 
 		 326 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  26.44 
 
 		 287 aa  49.3  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  29.66 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  26.9 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  24.38 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  29.08 
 
 		 341 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  23.44 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1405  amidohydrolase 2  22.13 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  29.08 
 
 		 341 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  29.08 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  28.75 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  25.66 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  29.08 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  26.51 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  24.29 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  22.99 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  23.04 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  27.36 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  31.46 
 
 		 268 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  25.89 
 
 		 271 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  24.9 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  25.61 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  24.6 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2218  amidohydrolase 2  28.35 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252084  normal  0.0155453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5103  amidohydrolase 2  24.7 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477462  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  33.68 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  28.23 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  24.12 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  36.67 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  25.1 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.53 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2903  amidohydrolase 2  26.55 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.844973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  25.79 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  26.34 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  25.9 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  26.39 
 
 		 297 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  23 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2002  amidohydrolase 2  21.81 
 
 		 256 aa  42.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0199491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 343 aa  42  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>