65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2978 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  100 
 
 		 297 aa  585  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  92.59 
 
 		 297 aa  544  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  65.74 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  60.75 
 
 		 297 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  60.69 
 
 		 333 aa  332  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  55.56 
 
 		 308 aa  328  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  59.51 
 
 		 285 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  58.28 
 
 		 884 aa  322  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  58.28 
 
 		 296 aa  314  9e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  57.48 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  53.15 
 
 		 311 aa  309  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  54.01 
 
 		 358 aa  298  7e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  51.05 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  51.42 
 
 		 289 aa  271  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  33.21 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  27.96 
 
 		 279 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  29.08 
 
 		 341 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  29.08 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  29.08 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  29.08 
 
 		 341 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  33.69 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23.08 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  24.69 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  30.29 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  30.35 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  28 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  32.69 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  26.53 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30.82 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  31.21 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  28.5 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  25.87 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  29.56 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  22.7 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.99 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  31.45 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  23.28 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  29.37 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  24.31 
 
 		 287 aa  49.3  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  26.24 
 
 		 287 aa  49.3  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  27.66 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  27.66 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  27.66 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  22.54 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  24.26 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  28.47 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  25.53 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  29.94 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  21.88 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  27.54 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.22 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  25.99 
 
 		 368 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  27.53 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  27.45 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  26.03 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  25.14 
 
 		 218 aa  42.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 299 aa  42.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>