87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1422 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  72.24 
 
 		 262 aa  388  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  64.89 
 
 		 266 aa  358  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  56.39 
 
 		 280 aa  315  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  58.37 
 
 		 280 aa  296  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  41.45 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  36.09 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  34.08 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.42 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  36.7 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  31.75 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  35.06 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  27.37 
 
 		 288 aa  85.9  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  28.84 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  30.59 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  22.86 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  27.46 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  28.36 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  26 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0903  amidohydrolase 2  29.82 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.162994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  26.09 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  34.67 
 
 		 381 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  28.48 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  28.68 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  27.47 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  23.77 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  31.37 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  28.22 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 358 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  28.5 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  24.59 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  29.61 
 
 		 392 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  25.72 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.71 
 
 		 287 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  23.95 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  30.88 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  23.45 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  25.26 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  25.26 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  28.04 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.41 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  27.08 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  22.71 
 
 		 282 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  24.91 
 
 		 288 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  28.23 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  26.57 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.21 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  29.56 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.01 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  28.75 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  23.77 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  24.92 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  24.8 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 333 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  24.12 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  23.18 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  23.85 
 
 		 301 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  21.43 
 
 		 279 aa  45.4  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  27.18 
 
 		 218 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  26.16 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  23.74 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  25.94 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  25.18 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  24.4 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  25.27 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  27.37 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  24.29 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  24.85 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0340  amidohydrolase 2  20.69 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2002  amidohydrolase 2  26.54 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0199491  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  28.34 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  26.4 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  23.29 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  24.89 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  25.43 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  24.88 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2889  hypothetical protein  31.76 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0597635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  24.44 
 
 		 304 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  21.13 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>