26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0340 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0340  amidohydrolase 2  100 
 
 
268 aa  556  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2889  hypothetical protein  22.95 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0597635  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  23.75 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25.97 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  22.98 
 
 
245 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  31.53 
 
 
275 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3078  hypothetical protein  21.77 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635173  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2374  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  23.25 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  23.85 
 
 
286 aa  49.3  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  22.99 
 
 
293 aa  48.9  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  22.96 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  21.83 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2373  hypothetical protein  22.14 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  21.46 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  22.34 
 
 
262 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  24.27 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  25.22 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  21.88 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  20.49 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  20.69 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  18.88 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  21.52 
 
 
280 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  19.17 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  26.76 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2369  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  25.76 
 
 
253 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56994  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  26.43 
 
 
305 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>