110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0855 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  100 
 
 		 280 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  56.39 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  56.65 
 
 		 262 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  53.01 
 
 		 266 aa  284  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  48.75 
 
 		 280 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  42.06 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  35.07 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  33.72 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  32.6 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  32.95 
 
 		 264 aa  143  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.76 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1297  amidohydrolase family protein  33.7 
 
 		 262 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0950172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  30.92 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  27.1 
 
 		 387 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  25.45 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  27.7 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  29.15 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  27.24 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  29.06 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  27.76 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  28.85 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  27.3 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  29.33 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  29.49 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.36 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  29.83 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  26.59 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  30.43 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  25.4 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  25.61 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  28.18 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  27.37 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  24.91 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  29.28 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  26.28 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  25.3 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  33.14 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  27.75 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  25 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  26.79 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  25.35 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  28.92 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0337  amidohydrolase 2  27.66 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  27.2 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  25 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  29.61 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  23.18 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  28.37 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  25.12 
 
 		 372 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  30.05 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  25 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  29.59 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  26.73 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2231  amidohydrolase 2  24.77 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211376  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  24.08 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  22.46 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  24.51 
 
 		 289 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0338  amidohydrolase 2  23.23 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  24.3 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  25.65 
 
 		 354 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0339  amidohydrolase 2  26.74 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 279 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  23.05 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  25.61 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0340  amidohydrolase 2  22.96 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  28.25 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  22.99 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2944  amidohydrolase 2  26.96 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19972  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  24.56 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  25.54 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  22.51 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  24.78 
 
 		 218 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  25 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  24.24 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  26.79 
 
 		 385 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2151  amidohydrolase 2  24.84 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  25 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.9 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  25 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  26.79 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  26.83 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  24.86 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  26.79 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1919  amidohydrolase 2  25.19 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.414859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  26.61 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  26.79 
 
 		 341 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  21.86 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2889  hypothetical protein  28.04 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0597635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  25.4 
 
 		 301 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0984  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 268 aa  43.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>