157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3920 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  100 
 
 
286 aa  584  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3277  amidohydrolase 2  41.96 
 
 
293 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3267  amidohydrolase 2  39.01 
 
 
329 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  unclonable  0.0000314139 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5784  amidohydrolase 2  32.99 
 
 
283 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1021  hypothetical protein  32.06 
 
 
283 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643261  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3770  amidohydrolase 2  26.95 
 
 
309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115169  normal  0.264283 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3877  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  28.16 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  28.29 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  28.29 
 
 
368 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  28.29 
 
 
327 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  28.29 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  28.29 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  28.29 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  28.29 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43770  predicted protein  26.62 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.02958  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5782  amidohydrolase 2  29.8 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43937  predicted protein  26.83 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00956853  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  29.62 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  27.38 
 
 
308 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  30.28 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  28.86 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  26.44 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  31.75 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  26.76 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  28.35 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  28.35 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  25.18 
 
 
291 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  24.04 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  25.48 
 
 
287 aa  62.4  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  25.9 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  29.56 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  27.04 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  28.14 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  26.41 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  26.41 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  25.85 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  26.3 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  26.06 
 
 
289 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  27.97 
 
 
275 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
297 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  25.89 
 
 
282 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  29.13 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  29.38 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  27.41 
 
 
293 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  26.04 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
276 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  25 
 
 
276 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  27.52 
 
 
278 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  25.1 
 
 
276 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  29.79 
 
 
291 aa  55.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1804  hypothetical protein  23.36 
 
 
329 aa  55.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  26.86 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  27.38 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09180  Amidohydrolase 2  25.71 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  25.95 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  25.2 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  28.46 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  28.85 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  27.38 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  27.2 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  26.14 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  23.79 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  28.46 
 
 
302 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  25.98 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  27.34 
 
 
314 aa  53.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  27.84 
 
 
302 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  27.62 
 
 
275 aa  52.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  26.26 
 
 
283 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  26.86 
 
 
307 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
272 aa  52.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3033  amidohydrolase 2  25.9 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.277355  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  27.38 
 
 
312 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
258 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  26.12 
 
 
312 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
273 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4793  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
387 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  22.05 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  26.91 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  23.58 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  25.51 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  25.26 
 
 
280 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  24.69 
 
 
245 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  28.98 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  26.19 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  24.51 
 
 
348 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  27.38 
 
 
304 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3599  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
288 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548656  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  23.64 
 
 
274 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  24.83 
 
 
296 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  26.98 
 
 
304 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2516  amidohydrolase 2  24.89 
 
 
345 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.125947  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  27.18 
 
 
277 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  30.08 
 
 
276 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>