71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3582 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  100 
 
 
290 aa  588  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2750  amidohydrolase 2  38.64 
 
 
387 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1835  amidohydrolase 2  38.77 
 
 
381 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2096  amidohydrolase 2  31.88 
 
 
280 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0644654 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  31.15 
 
 
282 aa  122  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  31.37 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  30.51 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0143  amidohydrolase 2  27.95 
 
 
280 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0855  amidohydrolase 2  30.1 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000589459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2759  amidohydrolase 2  29.05 
 
 
245 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0590433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  28.17 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  27.94 
 
 
279 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2099  amidohydrolase 2  30.99 
 
 
262 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  27.74 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0307  amidohydrolase 2  27.15 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  25.76 
 
 
348 aa  59.3  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.98 
 
 
345 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  27.54 
 
 
364 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  31.88 
 
 
280 aa  55.8  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2888  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
255 aa  55.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0545396  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  29.48 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  23.23 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.97 
 
 
268 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5103  amidohydrolase 2  31.3 
 
 
243 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477462  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  23 
 
 
288 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  27.09 
 
 
323 aa  52.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43770  predicted protein  25.27 
 
 
327 aa  52.4  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.02958  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  25.38 
 
 
313 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  32.84 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
312 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  25.88 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  27.96 
 
 
301 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.65 
 
 
333 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  26.09 
 
 
321 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  28.16 
 
 
279 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2842  amidohydrolase 2  29.07 
 
 
338 aa  49.3  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  27.56 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.3 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  22.97 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  24.28 
 
 
341 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.16 
 
 
339 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  26.27 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  24.89 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  29.56 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5107  amidohydrolase 2  31.28 
 
 
258 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.433963  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  24.6 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2736  amidohydrolase family protein  28.98 
 
 
266 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  25.98 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0925  putative transducer (chemotactic transducer pcta)  24 
 
 
263 aa  46.2  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00204533  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  27.8 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3079  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold- like protein  28.75 
 
 
278 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160711  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0638  amidohydrolase 2  27.11 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  24.13 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  24.49 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.27 
 
 
383 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3069  amidohydrolase 2  26.22 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0803355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4869  amidohydrolase 2  27.43 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127559  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13940  amidohydrolase 2  21.29 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0383348  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  24.8 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  26.24 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  28.68 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3788  amidohydrolase 2  24.69 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0676519  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  24.81 
 
 
279 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  25.5 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3611  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  27.86 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  23.64 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  25.1 
 
 
339 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  24.55 
 
 
308 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  27.89 
 
 
287 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>