141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43770 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43770  predicted protein  100 
 
 
327 aa  679    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.02958  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43937  predicted protein  39.77 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00956853  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  30.38 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  29.12 
 
 
302 aa  86.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  27.7 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  27.42 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  27.33 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  27.72 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  29.67 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  29.67 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  29.15 
 
 
295 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  28.12 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  28.03 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  24.76 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  28.3 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3277  amidohydrolase 2  26.28 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257981 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  27.05 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  27.76 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1021  hypothetical protein  26.83 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643261  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  28.35 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  26.42 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  26.42 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  26.42 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  25.69 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  26.42 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5782  amidohydrolase 2  29.39 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  26.42 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  26.42 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  26.42 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  25.95 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3770  amidohydrolase 2  24.84 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115169  normal  0.264283 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  28.87 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  25.6 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  28.52 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  28.52 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  28.52 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  28.52 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  28.52 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3267  amidohydrolase 2  26.85 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  unclonable  0.0000314139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  27.66 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  26.22 
 
 
281 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5784  amidohydrolase 2  24.91 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  26.62 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  27.78 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  26.51 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  27.69 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  24.04 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3877  amidohydrolase 2  27.73 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  23.89 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  27.4 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
277 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
300 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  24.01 
 
 
279 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  23.16 
 
 
275 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  22.81 
 
 
289 aa  59.7  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  25.09 
 
 
290 aa  59.3  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  25.49 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  27.57 
 
 
274 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  22.46 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  23.59 
 
 
292 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  25.81 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  25.98 
 
 
302 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  25.5 
 
 
287 aa  56.6  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  25.1 
 
 
290 aa  56.2  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  23.18 
 
 
287 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  27.8 
 
 
290 aa  55.8  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  24.84 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1919  amidohydrolase 2  26.06 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.414859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  24.24 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  25.3 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  25.44 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  26.04 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  21.32 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  22.81 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  20.76 
 
 
321 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  23.26 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  28.68 
 
 
275 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  27.66 
 
 
291 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1804  hypothetical protein  21.78 
 
 
329 aa  52.8  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  24.7 
 
 
296 aa  52.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3582  amidohydrolase 2  25.27 
 
 
290 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.676083  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  23.75 
 
 
300 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  25.3 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  22.84 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4793  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  23.51 
 
 
266 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  24.18 
 
 
286 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  22.29 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  23.08 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  23.9 
 
 
304 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  23.26 
 
 
276 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  25.44 
 
 
277 aa  49.3  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  22.65 
 
 
309 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  25.59 
 
 
280 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  22.95 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  24.09 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  20.36 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>