170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05190 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  100 
 
 		 302 aa  597  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  80.98 
 
 		 306 aa  487  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  80.98 
 
 		 306 aa  487  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  61.34 
 
 		 282 aa  305  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  55.29 
 
 		 303 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  61.71 
 
 		 296 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  61.34 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  60.97 
 
 		 296 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  60.97 
 
 		 296 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  60.97 
 
 		 296 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  60.97 
 
 		 296 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  56.72 
 
 		 298 aa  298  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  61.03 
 
 		 299 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  55.56 
 
 		 291 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  51.69 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  51.47 
 
 		 284 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  50.56 
 
 		 330 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  50.56 
 
 		 330 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  50.56 
 
 		 330 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  50.56 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  50.56 
 
 		 327 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  50.56 
 
 		 330 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  50.56 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  50.56 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  56.02 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  51.84 
 
 		 281 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  50.19 
 
 		 297 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  49.28 
 
 		 280 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  48.56 
 
 		 280 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  52.26 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  48.19 
 
 		 277 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  46.84 
 
 		 277 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  43.17 
 
 		 274 aa  235  7e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  43.51 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  41.64 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0660  hypothetical protein  31.48 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0270681  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0581  hypothetical protein  31.48 
 
 		 265 aa  159  7e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  37.55 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  33.46 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  33.46 
 
 		 275 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3775  amidohydrolase 2  37.64 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0945116 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  33.08 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  37.59 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3800  amidohydrolase 2  43.16 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  34.66 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  37.31 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  38.83 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  38.89 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  39.26 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  37.13 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  38.52 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  35.58 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  33.21 
 
 		 279 aa  128  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  33.21 
 
 		 287 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  34.15 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  33.94 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  34.53 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  33.09 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  35.32 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  34.69 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  34.07 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  34.69 
 
 		 275 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  31.97 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  31.9 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  32.28 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  32.01 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  30.42 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  32.25 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  31.65 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  31.5 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  36.23 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  33.58 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  31.54 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  30.82 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  33.48 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  29.55 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  30.82 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  29.1 
 
 		 302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  31.85 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  30.94 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  32.85 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  30.94 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  31.48 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  32.01 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  32.85 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  30.07 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  33.77 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  38.02 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  33.09 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  29.68 
 
 		 314 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  28.84 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  31.99 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  30.6 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  33.46 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  34.44 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  34.2 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>