196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2432 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  100 
 
 
277 aa  551  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  47.45 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  49.08 
 
 
275 aa  241  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  48.91 
 
 
348 aa  228  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  48.4 
 
 
278 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  46.04 
 
 
290 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  46.4 
 
 
290 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  43.48 
 
 
276 aa  224  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  44.2 
 
 
276 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  45.82 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  43.48 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  45.82 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  45.82 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  45.82 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  45.82 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  45.82 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  44.93 
 
 
290 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  45.42 
 
 
291 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  45.29 
 
 
290 aa  209  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  41.43 
 
 
274 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  44.72 
 
 
291 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  44.72 
 
 
291 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  44.04 
 
 
279 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  40.7 
 
 
291 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  38.77 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  46.15 
 
 
272 aa  195  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  38.72 
 
 
286 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  39.01 
 
 
288 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  39.13 
 
 
278 aa  182  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  42.6 
 
 
275 aa  182  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  37.68 
 
 
275 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  41.58 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  36.56 
 
 
274 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  39.35 
 
 
283 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  40.5 
 
 
285 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  38.49 
 
 
280 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  42.19 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  29.09 
 
 
278 aa  162  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  36.1 
 
 
287 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  34.07 
 
 
276 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  39.43 
 
 
273 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  34.04 
 
 
285 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  37.98 
 
 
295 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  29.51 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  38.63 
 
 
274 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  35.91 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  35.91 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  35.91 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  35.52 
 
 
296 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  35.14 
 
 
296 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  31.34 
 
 
278 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  31.21 
 
 
278 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  33.61 
 
 
281 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  34.92 
 
 
290 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  35.98 
 
 
291 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  34.65 
 
 
296 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  29.72 
 
 
282 aa  116  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  32.69 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  30.69 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  29.12 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  31.44 
 
 
299 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  31.34 
 
 
292 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  27.42 
 
 
297 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  32.44 
 
 
313 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  28.21 
 
 
278 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
314 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  32.11 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  28.57 
 
 
307 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  30.48 
 
 
319 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  29.55 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  30.69 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  30.45 
 
 
318 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  30.46 
 
 
322 aa  92  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  27.03 
 
 
307 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  31.91 
 
 
318 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  30.14 
 
 
319 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  29.66 
 
 
297 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  32.25 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  30.1 
 
 
320 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  30.11 
 
 
297 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  28.25 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  30.28 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  26.83 
 
 
303 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  30.1 
 
 
319 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  30.1 
 
 
319 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09180  Amidohydrolase 2  28.92 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  24.15 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  27.52 
 
 
335 aa  82  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  28.9 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  29.19 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  29.19 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  29.19 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  22.76 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  27.24 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  27.12 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3920  amidohydrolase 2  26.39 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4264  amidohydrolase 2  33.11 
 
 
378 aa  72.4  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  26.13 
 
 
348 aa  72.4  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>