152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1992 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  100 
 
 
275 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  55.27 
 
 
276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  54.18 
 
 
274 aa  321  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  53.11 
 
 
278 aa  318  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  51.65 
 
 
276 aa  299  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  48.91 
 
 
276 aa  279  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  45.99 
 
 
287 aa  244  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  46.15 
 
 
296 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  46.48 
 
 
290 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  41.88 
 
 
280 aa  228  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  45.07 
 
 
310 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  45.07 
 
 
296 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  45.07 
 
 
296 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  41.52 
 
 
279 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  42.6 
 
 
285 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  42.18 
 
 
274 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  44.37 
 
 
296 aa  224  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  44.37 
 
 
296 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  42.09 
 
 
277 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  41.07 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  40.87 
 
 
286 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  40.79 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  38.99 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  42.35 
 
 
261 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  40 
 
 
276 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  39.64 
 
 
276 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  39.93 
 
 
295 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  42.09 
 
 
274 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  39.07 
 
 
273 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  38.77 
 
 
290 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  39.08 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  37.59 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  40.14 
 
 
270 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  38.04 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  39.27 
 
 
348 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  37.59 
 
 
275 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  37.68 
 
 
277 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  37.77 
 
 
291 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  37.41 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  37.41 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  38.27 
 
 
279 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  38.27 
 
 
279 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  38.27 
 
 
279 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  38.27 
 
 
279 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  38.27 
 
 
279 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  37.91 
 
 
279 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  34.29 
 
 
288 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  35.19 
 
 
285 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  37.09 
 
 
290 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  34.67 
 
 
272 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  38.83 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  37.09 
 
 
290 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
275 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  38.17 
 
 
291 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  29.25 
 
 
297 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  29.68 
 
 
278 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  31.58 
 
 
292 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  26.86 
 
 
278 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  27.87 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  29.93 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  30.61 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  26.13 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  30.43 
 
 
281 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  28.76 
 
 
299 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  26.32 
 
 
291 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  26.03 
 
 
307 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  27.12 
 
 
297 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  23.53 
 
 
304 aa  105  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  27.95 
 
 
314 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  28.99 
 
 
260 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  26.76 
 
 
298 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  26.42 
 
 
298 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  26.42 
 
 
298 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  26.85 
 
 
298 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  25.93 
 
 
307 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  26.6 
 
 
319 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  26.6 
 
 
322 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  26.35 
 
 
297 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  32.52 
 
 
348 aa  95.9  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  29.19 
 
 
307 aa  95.5  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  25.07 
 
 
360 aa  95.5  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
302 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  25.65 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  26.26 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  26.85 
 
 
295 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  25.76 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  27.87 
 
 
318 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  26.51 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
320 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
313 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  26.1 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
319 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
319 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  26.81 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  25.7 
 
 
335 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  23.31 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  23.99 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  21.66 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>