162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4454 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  100 
 
 
304 aa  605  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  52.03 
 
 
368 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  52.03 
 
 
327 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  52.03 
 
 
330 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  52.03 
 
 
330 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  52.03 
 
 
330 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  52.03 
 
 
324 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  52.03 
 
 
330 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  50.71 
 
 
308 aa  277  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  54.1 
 
 
296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  54.14 
 
 
306 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  54.14 
 
 
306 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  53.73 
 
 
303 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  56.02 
 
 
302 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  52.61 
 
 
282 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  53.36 
 
 
296 aa  255  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  52.99 
 
 
295 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  52.99 
 
 
296 aa  254  9e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  52.99 
 
 
296 aa  254  9e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  52.99 
 
 
296 aa  254  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  52.99 
 
 
296 aa  254  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  53.05 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  51.37 
 
 
281 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  52.03 
 
 
299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  48.51 
 
 
280 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  48.88 
 
 
280 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  48.5 
 
 
297 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  50.91 
 
 
291 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  49.45 
 
 
295 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  47.76 
 
 
277 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  46.74 
 
 
277 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  47.54 
 
 
284 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  42.38 
 
 
274 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  40.98 
 
 
272 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0660  hypothetical protein  31 
 
 
265 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0270681  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0581  hypothetical protein  31 
 
 
265 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3800  amidohydrolase 2  46.44 
 
 
281 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  38.43 
 
 
266 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  35 
 
 
290 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3775  amidohydrolase 2  38.46 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0945116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
300 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  35.21 
 
 
289 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  34.81 
 
 
275 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  34.46 
 
 
289 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  36.17 
 
 
290 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  37.45 
 
 
300 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  37.18 
 
 
291 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  40.42 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  36.73 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  37.94 
 
 
289 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  40.83 
 
 
305 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  34.68 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  37.77 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  36.07 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  38.79 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  37.14 
 
 
327 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  36.14 
 
 
296 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  34.98 
 
 
304 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  34.01 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  34.84 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  34.98 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  34.57 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  33.94 
 
 
276 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  34.02 
 
 
304 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  34.27 
 
 
314 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  33.06 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  33.09 
 
 
275 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  32.09 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  31.84 
 
 
274 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  34.57 
 
 
294 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  36 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  36.42 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  33.04 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  31.87 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  33.04 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  30.22 
 
 
310 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  29.55 
 
 
283 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  32 
 
 
302 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  35.04 
 
 
275 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  29.48 
 
 
310 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  32.91 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  34.41 
 
 
273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  35.1 
 
 
295 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  38.3 
 
 
302 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  31.6 
 
 
309 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  29.74 
 
 
272 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  32.46 
 
 
296 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  32.7 
 
 
287 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  30.29 
 
 
279 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  30.11 
 
 
312 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  29.31 
 
 
323 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  30.86 
 
 
282 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  33.2 
 
 
287 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  35.22 
 
 
286 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  32.23 
 
 
304 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  34.8 
 
 
290 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  30.88 
 
 
312 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  30.4 
 
 
297 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  31.25 
 
 
290 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  30.88 
 
 
306 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>