159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0169 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  100 
 
 
305 aa  625  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  79.8 
 
 
312 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  78.15 
 
 
304 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  77.45 
 
 
314 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  78.62 
 
 
305 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  77.15 
 
 
304 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  77.56 
 
 
304 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  78.67 
 
 
313 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  77.74 
 
 
327 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  74.16 
 
 
302 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  71.33 
 
 
302 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  72 
 
 
312 aa  461  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  68.75 
 
 
307 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  70.76 
 
 
295 aa  441  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  68.09 
 
 
302 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  60.62 
 
 
290 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  53.24 
 
 
296 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  49.13 
 
 
287 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  49.47 
 
 
302 aa  251  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  44.41 
 
 
287 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  44.26 
 
 
290 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  40.54 
 
 
323 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  40.48 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  38.97 
 
 
310 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  38.97 
 
 
310 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  38.33 
 
 
300 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  38.97 
 
 
310 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  38.28 
 
 
310 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  39.31 
 
 
312 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  37.19 
 
 
294 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  37.72 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  38.28 
 
 
309 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  37.96 
 
 
286 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  36.1 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  35.84 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  38.1 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  38.41 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  35.48 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  37.23 
 
 
271 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  36.5 
 
 
271 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  34.27 
 
 
283 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  37.68 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  35.46 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  35.64 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  35.19 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  34.45 
 
 
295 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  37.81 
 
 
306 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  38.16 
 
 
296 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  38.41 
 
 
274 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  35.44 
 
 
289 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  32.08 
 
 
320 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  35.64 
 
 
295 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
296 aa  158  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  37.32 
 
 
297 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  33 
 
 
295 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  35.42 
 
 
296 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
321 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  37.81 
 
 
273 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  34.97 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  35.14 
 
 
272 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  36.09 
 
 
296 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  38.41 
 
 
290 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  36.93 
 
 
290 aa  148  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
293 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
293 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  35.96 
 
 
325 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  36 
 
 
293 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  34.39 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  35.11 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  37.59 
 
 
311 aa  139  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  34.63 
 
 
320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  31.21 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  34.98 
 
 
280 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
280 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  35.69 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
308 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  32.98 
 
 
277 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  33.94 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  34.29 
 
 
284 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  34.98 
 
 
280 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  41.72 
 
 
198 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  41.72 
 
 
198 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  40.83 
 
 
304 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  35.97 
 
 
296 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  33.22 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  31.34 
 
 
287 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  32.48 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  32.48 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  31.77 
 
 
277 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  35.27 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  35.21 
 
 
290 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  32.38 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  32.14 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  30.5 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  32.14 
 
 
330 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  32.14 
 
 
368 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  32.14 
 
 
330 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  32.14 
 
 
327 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  32.14 
 
 
330 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>