140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3988 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  70.33 
 
 		 310 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  70.33 
 
 		 310 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  70.33 
 
 		 310 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  71.35 
 
 		 310 aa  265  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  52.47 
 
 		 312 aa  188  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  50 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  51.74 
 
 		 304 aa  178  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  49.38 
 
 		 309 aa  177  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  49.46 
 
 		 290 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  52.47 
 
 		 311 aa  170  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  54.73 
 
 		 282 aa  167  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  51.83 
 
 		 296 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  50.68 
 
 		 274 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  51.37 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  51.37 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  50.68 
 
 		 293 aa  148  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  45.12 
 
 		 280 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  40.76 
 
 		 286 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  44.59 
 
 		 271 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  43.15 
 
 		 272 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  42.17 
 
 		 321 aa  134  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  45.06 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  44 
 
 		 286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  44.79 
 
 		 304 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  42.19 
 
 		 297 aa  131  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  42.33 
 
 		 305 aa  131  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  43.92 
 
 		 271 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  40.48 
 
 		 312 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  42.33 
 
 		 313 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  40.76 
 
 		 289 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  45.78 
 
 		 320 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  42.33 
 
 		 304 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  43.51 
 
 		 273 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  40.62 
 
 		 286 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  40.49 
 
 		 302 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  41.72 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  41.72 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  41.1 
 
 		 304 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  42.33 
 
 		 327 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  41.1 
 
 		 315 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  40.49 
 
 		 312 aa  121  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  42.04 
 
 		 290 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  37.34 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  39.88 
 
 		 302 aa  118  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  41.57 
 
 		 320 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  37.35 
 
 		 307 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  41.56 
 
 		 289 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  41.56 
 
 		 275 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  41.56 
 
 		 289 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  39.88 
 
 		 302 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  37.74 
 
 		 283 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2714  putative 2-pyrone-4,6-dicarbaxylate hydrolase  51.33 
 
 		 167 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  34.91 
 
 		 306 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  40.38 
 
 		 302 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  37.97 
 
 		 295 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  40.14 
 
 		 287 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  36.94 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  36.77 
 
 		 300 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  39.38 
 
 		 325 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  34.34 
 
 		 296 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  39.33 
 
 		 318 aa  101  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  32.5 
 
 		 323 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  34.78 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  33.53 
 
 		 294 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  35 
 
 		 287 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0708  amidohydrolase 2  37.24 
 
 		 268 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63573e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0697  amidohydrolase 2  35.9 
 
 		 268 aa  95.5  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2276  amidohydrolase 2  35.44 
 
 		 260 aa  94.7  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523292  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3758  hypothetical protein  38.19 
 
 		 249 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  33.53 
 
 		 296 aa  91.7  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1722  amidohydrolase 2  38.89 
 
 		 248 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  39.53 
 
 		 271 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2127  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  88.2  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1983  amidohydrolase 2  33.1 
 
 		 247 aa  88.2  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.554072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  30.97 
 
 		 291 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  30.91 
 
 		 290 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0457  amidohydrolase 2  34.72 
 
 		 254 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  30.97 
 
 		 289 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2022  putative lactonase  33.33 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.244849  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2101  hypothetical protein  33.57 
 
 		 253 aa  86.3  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  36.77 
 
 		 281 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0172  amidohydrolase family protein  33.33 
 
 		 252 aa  86.3  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.222028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  30.97 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  37.25 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  36.6 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2493  amidohydrolase 2  40.56 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  36.6 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  36.6 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  36.6 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  36.6 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  36.6 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  36.6 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  33.79 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  31.61 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3800  amidohydrolase 2  44.06 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  35 
 
 		 272 aa  81.6  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  35.42 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  38.16 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>