127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0457 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0457  amidohydrolase 2  100 
 
 
254 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2276  amidohydrolase 2  59.04 
 
 
260 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523292  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2127  hypothetical protein  56.85 
 
 
253 aa  299  3e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1983  amidohydrolase 2  58.02 
 
 
247 aa  298  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.554072  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2101  hypothetical protein  56.45 
 
 
253 aa  296  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3758  hypothetical protein  60.41 
 
 
249 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0708  amidohydrolase 2  57.72 
 
 
268 aa  288  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63573e-27 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1722  amidohydrolase 2  59.59 
 
 
248 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164303  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0697  amidohydrolase 2  56.91 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146156  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2022  putative lactonase  51.2 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.244849  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0172  amidohydrolase family protein  51.6 
 
 
252 aa  272  3e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.222028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2493  amidohydrolase 2  58.37 
 
 
254 aa  261  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1876  amidohydrolase 2  55.92 
 
 
255 aa  258  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0123209  normal  0.0185409 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  29.28 
 
 
310 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  28.79 
 
 
310 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  28.79 
 
 
310 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  28.41 
 
 
310 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  35.48 
 
 
280 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  31.8 
 
 
312 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  29.89 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  30.65 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  34.84 
 
 
293 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  34.84 
 
 
293 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  34.84 
 
 
293 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  28.63 
 
 
300 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  34.72 
 
 
198 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  34.72 
 
 
198 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
274 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  27.97 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  27.97 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  26.02 
 
 
323 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  31.82 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  27.99 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  28.7 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  27.38 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  28.63 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  28.2 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  30.19 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  25.19 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  26.52 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  25.77 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  31.06 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  26.15 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  26.62 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  31.82 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  29.2 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  27.38 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  28.9 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  31.37 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  26.13 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  29.66 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  26.62 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  30.42 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  26.72 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  28.45 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  27.65 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  26.87 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  24.5 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  28.82 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  28.02 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  29.61 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  29.24 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  27.54 
 
 
307 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  27.59 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  27.95 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  24.77 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  26.79 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  28.7 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  27.95 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  27.68 
 
 
302 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  28.16 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  27.97 
 
 
312 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  27.63 
 
 
290 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  26.34 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  25.27 
 
 
318 aa  62.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  26.53 
 
 
287 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  27.78 
 
 
304 aa  62  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  30.81 
 
 
313 aa  62  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  27.88 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  26.15 
 
 
290 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  28.29 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  31.06 
 
 
296 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  26.58 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  27.92 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  27.9 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  30.43 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  30.43 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  30.43 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  30.43 
 
 
295 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  30.43 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
296 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  24.44 
 
 
290 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  25.46 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  27.17 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  26.52 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  25 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  27.35 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  26.38 
 
 
297 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  23.08 
 
 
320 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>