147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5880 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  100 
 
 		 285 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  57.75 
 
 		 274 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  37.81 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  37.81 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  37.46 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  38.6 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  36.07 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  40.07 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  37.46 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  35.84 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  39.72 
 
 		 289 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  36.65 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  35.48 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  39.5 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  35.69 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  37.01 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  33.69 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  32.26 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  32.26 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  37.68 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  37.01 
 
 		 296 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  32.62 
 
 		 287 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  37.28 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  34.81 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  36.79 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  35.05 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  34.98 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  34.6 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  33.1 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  37.37 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  32.98 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  36.92 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  37.37 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  37.37 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  30.32 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  34.04 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  32.14 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  30.82 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  33.22 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  31.67 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  32.87 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  30.9 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  31.93 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  32.76 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  32.06 
 
 		 307 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  30.56 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  31.6 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  29.66 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  33.69 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  30.63 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  30.56 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  29.72 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  29.93 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  30.88 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  36.51 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  29.51 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  29.51 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  29.82 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  35.86 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  35.86 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  32.98 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  31.58 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  34.86 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  28.82 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  34.04 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  29.31 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  32.65 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  32.18 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  36.04 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  30.88 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  33.57 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  36.1 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  30.63 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  35.74 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  31.23 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  30.42 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  35.38 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  35.38 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  35.38 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  35.38 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  28.93 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  31.12 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  31.43 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  30.28 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  35.23 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  32.14 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  31.18 
 
 		 290 aa  92  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  30.28 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  35.71 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  32.13 
 
 		 330 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  32.13 
 
 		 330 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>