154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0604 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  100 
 
 		 286 aa  585  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  51.94 
 
 		 300 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  48.01 
 
 		 289 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  50.56 
 
 		 289 aa  254  8e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  50.56 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  50.56 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  47.62 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  47.62 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  47.62 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  47.99 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  47.25 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  45.26 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  48.13 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  47.01 
 
 		 291 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  42.31 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  43.43 
 
 		 312 aa  228  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  43.43 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  43.05 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  43.8 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  41.75 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  41.84 
 
 		 294 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  47.08 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  41.79 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  41.82 
 
 		 286 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  42.44 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  41.45 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  41.13 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  43.36 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  42.38 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  37.88 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  41.67 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  40 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  43.77 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  43.77 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  43.77 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  40.14 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  40.21 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  38.49 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  41.37 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  39.08 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  37.41 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  42.86 
 
 		 271 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  38.1 
 
 		 327 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  40.3 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  42.54 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  37.07 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  42.48 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  36.46 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  37.07 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  38.25 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  41.82 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  38.06 
 
 		 282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  38.03 
 
 		 305 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  40.42 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  37.18 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  42.45 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  36.05 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  38.72 
 
 		 272 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  35.71 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  36.07 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  37.89 
 
 		 305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  35.03 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  41.11 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  37.28 
 
 		 321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  39.65 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  39.07 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  38.6 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  40.58 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  34.78 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  38.04 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  38.99 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  36 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  39.21 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  36.43 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  35.17 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  36.07 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  34.41 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  38.46 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  34.69 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  43.95 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  43.95 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  35.51 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  34.44 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  35.36 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  34.08 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  29.74 
 
 		 318 aa  129  7.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  35.41 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  32.22 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  32.21 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  31.64 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  35.42 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  36.32 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  32.22 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  34.32 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  32.26 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  34.43 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  32.59 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  34.43 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>