156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3206 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  100 
 
 
302 aa  621  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  80 
 
 
305 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  78.81 
 
 
304 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  77.48 
 
 
304 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  77.48 
 
 
304 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  77.48 
 
 
327 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  76.08 
 
 
312 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  74.75 
 
 
314 aa  498  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  77.26 
 
 
313 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  76.16 
 
 
302 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  73.58 
 
 
312 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  71.33 
 
 
305 aa  471  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  74.4 
 
 
295 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  67.33 
 
 
302 aa  435  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  67.79 
 
 
307 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  61.99 
 
 
290 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  53.9 
 
 
296 aa  322  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  48.59 
 
 
302 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  43.36 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  44.41 
 
 
287 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  44.41 
 
 
287 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  46.55 
 
 
290 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  37.54 
 
 
294 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  37.46 
 
 
300 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  37.85 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  37.85 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  36.14 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  39.1 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  36.14 
 
 
275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  38.19 
 
 
310 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  36.14 
 
 
289 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
310 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  37.96 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  37.59 
 
 
312 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  34.49 
 
 
289 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  34.38 
 
 
291 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  35.89 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  34.03 
 
 
300 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  37.68 
 
 
304 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  34.86 
 
 
289 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  33 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  36.24 
 
 
306 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  35.17 
 
 
309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  36.96 
 
 
274 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  35.34 
 
 
297 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  35.64 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
295 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  34.91 
 
 
271 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  33.66 
 
 
295 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  33.44 
 
 
295 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  32.28 
 
 
283 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  31.93 
 
 
286 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
296 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  32.51 
 
 
321 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  33.55 
 
 
296 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  34.78 
 
 
282 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  32.75 
 
 
286 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  34.74 
 
 
273 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  35.92 
 
 
296 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  35.76 
 
 
290 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  32.75 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  35.4 
 
 
293 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  35.4 
 
 
293 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  35.4 
 
 
293 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  34.39 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  34.03 
 
 
315 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  33.91 
 
 
290 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  34.83 
 
 
311 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  32.31 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  33.1 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  28.96 
 
 
290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  30.77 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  34.28 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  40.49 
 
 
198 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
281 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  40.49 
 
 
198 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  30.32 
 
 
280 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  31.75 
 
 
306 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  31.75 
 
 
306 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  30.69 
 
 
295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  32.73 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  28.82 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  28.28 
 
 
277 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  27.93 
 
 
280 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  29.6 
 
 
277 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  31.93 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  29.72 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  31.48 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  27.93 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  28.42 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  30.71 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  32.26 
 
 
296 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  30.74 
 
 
302 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  31.9 
 
 
330 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  30.32 
 
 
276 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  31.9 
 
 
330 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  31.18 
 
 
327 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  31.9 
 
 
330 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>