153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5617 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  100 
 
 
312 aa  620  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  81.09 
 
 
312 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  75.96 
 
 
309 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  53.47 
 
 
304 aa  321  9.000000000000001e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  50 
 
 
310 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  50 
 
 
310 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  49.03 
 
 
310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  51.05 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  52.86 
 
 
315 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  48.98 
 
 
308 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  50.7 
 
 
290 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  47.16 
 
 
297 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  49.62 
 
 
282 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  47.2 
 
 
311 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  44.6 
 
 
321 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  49.13 
 
 
320 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  47.22 
 
 
296 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  43.7 
 
 
272 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  47.57 
 
 
274 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  43.45 
 
 
286 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  48.68 
 
 
293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  48.68 
 
 
293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  48.3 
 
 
293 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  39.57 
 
 
289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  43.64 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  42.7 
 
 
287 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  40.62 
 
 
307 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  39.05 
 
 
306 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  39.05 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  40.07 
 
 
286 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  37.5 
 
 
289 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  37.5 
 
 
275 aa  199  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  40.14 
 
 
305 aa  198  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  40.48 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  37.13 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  40.98 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  40.98 
 
 
271 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  39.79 
 
 
302 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  41.67 
 
 
295 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  41.03 
 
 
295 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  39.45 
 
 
327 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  41.51 
 
 
280 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  39.56 
 
 
289 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  39.45 
 
 
304 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  38.75 
 
 
304 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  40.65 
 
 
290 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  43.07 
 
 
294 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  36.4 
 
 
283 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  38.75 
 
 
312 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  39.1 
 
 
302 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  38.41 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  38.28 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  38.57 
 
 
314 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  37.72 
 
 
312 aa  188  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  38.41 
 
 
304 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  35.71 
 
 
323 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  40.58 
 
 
286 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  52.47 
 
 
198 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  52.47 
 
 
198 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  37.93 
 
 
313 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  38.68 
 
 
289 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  39.71 
 
 
291 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  38.84 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  36.23 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  36.96 
 
 
290 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  38.99 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  35.14 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  38.46 
 
 
300 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  36.63 
 
 
290 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  38.91 
 
 
302 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  37.46 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  38.24 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  36.9 
 
 
301 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  35.94 
 
 
295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  37.32 
 
 
296 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  33.7 
 
 
287 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  34.4 
 
 
295 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  34.7 
 
 
296 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  38.46 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  34.41 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  33.58 
 
 
295 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 
318 aa  127  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  33.96 
 
 
277 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  33.45 
 
 
303 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  34.04 
 
 
285 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  36.02 
 
 
271 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  32.71 
 
 
276 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  31.25 
 
 
275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  30.34 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  32.12 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  32.12 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  32.12 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  32.12 
 
 
324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  32.12 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  32.12 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  32.12 
 
 
368 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2276  amidohydrolase 2  32.57 
 
 
260 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  33.95 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  32.96 
 
 
296 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  32.79 
 
 
318 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>