157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3066 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  100 
 
 
302 aa  604  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  55.33 
 
 
287 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  56.36 
 
 
287 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  52.61 
 
 
323 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  52.1 
 
 
295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  50.35 
 
 
327 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  47.59 
 
 
314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  48.8 
 
 
302 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  47.23 
 
 
304 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  47.57 
 
 
304 aa  265  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  48.25 
 
 
312 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  46.85 
 
 
302 aa  265  8e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  47.44 
 
 
302 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  49.48 
 
 
305 aa  261  6.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  46.76 
 
 
290 aa  259  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  45.93 
 
 
304 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  46.85 
 
 
312 aa  258  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  47.4 
 
 
313 aa  256  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  47.2 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  47.92 
 
 
296 aa  249  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  46.21 
 
 
307 aa  247  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  47.1 
 
 
290 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  43.27 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  43.27 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  43.27 
 
 
289 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  43.71 
 
 
300 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  45.64 
 
 
290 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  46.49 
 
 
286 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  42.5 
 
 
310 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  39.72 
 
 
296 aa  202  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  42.31 
 
 
306 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  40.75 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  39.34 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  42.14 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  42.14 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  41.79 
 
 
310 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  41.44 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  42.01 
 
 
297 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  37.12 
 
 
320 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  39.53 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  42.31 
 
 
296 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  41.24 
 
 
295 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  40.07 
 
 
286 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  38.79 
 
 
289 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  38.6 
 
 
271 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  37.72 
 
 
286 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  39.58 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  38.6 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  38.57 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  38.79 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  37.37 
 
 
321 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  38.7 
 
 
295 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  38.11 
 
 
289 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  38.89 
 
 
272 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  37.88 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  37.36 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  44.06 
 
 
311 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  36.27 
 
 
283 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  40 
 
 
273 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
309 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  38.93 
 
 
274 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  40.2 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  38.19 
 
 
315 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  38.21 
 
 
320 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  38.01 
 
 
280 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
296 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  37.63 
 
 
290 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  37.87 
 
 
293 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
293 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
293 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  36.65 
 
 
285 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
290 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  32.88 
 
 
287 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  32.86 
 
 
287 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  36.3 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  37.09 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  34.89 
 
 
301 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  36.04 
 
 
271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  34.01 
 
 
325 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  39.78 
 
 
296 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  36.71 
 
 
295 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  35.96 
 
 
280 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  34.72 
 
 
277 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  36.3 
 
 
280 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  30.04 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  33.7 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  34.89 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  36.5 
 
 
298 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  34.31 
 
 
282 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  34.53 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  34.31 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  34.52 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  34.31 
 
 
296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  33.69 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  34.31 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  34.31 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  34.53 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  34.53 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  34.31 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  34.53 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>