151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2147 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  100 
 
 
290 aa  587  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  47.12 
 
 
307 aa  260  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  49.13 
 
 
295 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  45.27 
 
 
312 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  46.55 
 
 
302 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  45.94 
 
 
290 aa  244  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  45.52 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  45.86 
 
 
302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  46.04 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  46.59 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  46.13 
 
 
302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  44.48 
 
 
304 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  44.83 
 
 
305 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  42.33 
 
 
314 aa  238  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  43.45 
 
 
304 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  44.26 
 
 
305 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  43.1 
 
 
304 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  43.26 
 
 
323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  47.27 
 
 
302 aa  234  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  43.24 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  42.52 
 
 
296 aa  232  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  42.52 
 
 
312 aa  226  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  38.97 
 
 
312 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  40.65 
 
 
312 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  40.94 
 
 
290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  38.49 
 
 
294 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  37.04 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  37.04 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  37.04 
 
 
289 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  38.33 
 
 
309 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  39.8 
 
 
296 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  36.19 
 
 
271 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  39.41 
 
 
274 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  35.06 
 
 
320 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  38.43 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  38.81 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  36.01 
 
 
304 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  39.13 
 
 
315 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  36.19 
 
 
271 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  33.94 
 
 
283 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  36.3 
 
 
295 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  38.43 
 
 
293 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  38.43 
 
 
293 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  35.34 
 
 
289 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  37.23 
 
 
295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  36.17 
 
 
291 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  34.33 
 
 
272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  38.13 
 
 
308 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  36.65 
 
 
289 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  35.53 
 
 
282 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  31.8 
 
 
321 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  34.42 
 
 
300 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  36.53 
 
 
289 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  35.36 
 
 
297 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
311 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  37.73 
 
 
286 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  35.34 
 
 
310 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  35.34 
 
 
310 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  36.9 
 
 
296 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  38.58 
 
 
286 aa  156  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  34.98 
 
 
310 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  37.09 
 
 
306 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  33.69 
 
 
286 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  35.71 
 
 
296 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  35.74 
 
 
310 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  35.12 
 
 
325 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  33.91 
 
 
295 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  36.82 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  38.85 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  32.16 
 
 
320 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  34.81 
 
 
296 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  32.72 
 
 
290 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  34.42 
 
 
273 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  32.62 
 
 
295 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
276 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  30.32 
 
 
285 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  34.57 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  31.67 
 
 
280 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  28.78 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  32.58 
 
 
274 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  29.77 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  31.5 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  31.5 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  35.09 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  30 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  30.6 
 
 
280 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  33.58 
 
 
308 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  30.25 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  32.59 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  32.59 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  32.59 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  32.59 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  32.59 
 
 
368 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  32.59 
 
 
324 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  32.59 
 
 
327 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  30.74 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  31.41 
 
 
281 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
277 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  32.37 
 
 
284 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>