152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3887 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  100 
 
 		 302 aa  628  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  74.1 
 
 		 305 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  72.85 
 
 		 304 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  71.85 
 
 		 327 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  73.6 
 
 		 304 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  73.18 
 
 		 304 aa  464  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  69.84 
 
 		 314 aa  458  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  72.43 
 
 		 312 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  71.24 
 
 		 313 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  70.67 
 
 		 312 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  70.47 
 
 		 302 aa  441  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  68.09 
 
 		 305 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  67.33 
 
 		 302 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  69.15 
 
 		 295 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  63.31 
 
 		 307 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  61.59 
 
 		 290 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  51.88 
 
 		 296 aa  322  7e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  46.43 
 
 		 287 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  43.57 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  46.43 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  46.4 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  46.13 
 
 		 290 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  37.72 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  39.79 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  36.63 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  36.63 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  36.63 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  38.75 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  38.06 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  37.46 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  36.52 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  36.52 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  36.17 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  36.56 
 
 		 294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  36.17 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  38.06 
 
 		 309 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  36.65 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  35.59 
 
 		 289 aa  178  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  35.97 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  36.04 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  33.91 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  33.81 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  34.46 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  38.01 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  36.3 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  36.05 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  35.71 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  37.41 
 
 		 274 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  36.16 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  36.2 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  33.95 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  33.56 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  32.37 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  34.44 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  36.7 
 
 		 293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  36.7 
 
 		 293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  35.96 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  32.36 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  33.56 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  32.01 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  32.76 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  32.54 
 
 		 296 aa  145  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  33.7 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  29.73 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  32.29 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  29.9 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  30.58 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  31.67 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  30.6 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  33.09 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  31.19 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  31.54 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  31.6 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  31.18 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  30.99 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  31.93 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  30.29 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  28.31 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  30.91 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  30.82 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  29.37 
 
 		 306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  29.37 
 
 		 306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  33.09 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  39.88 
 
 		 198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  39.88 
 
 		 198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  32.38 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  34.01 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  29.2 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  29 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  28.62 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  28.62 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  28.62 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  28.62 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  30.15 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  30.48 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  28.36 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>