162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4322 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  100 
 
 
302 aa  621  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  87 
 
 
304 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  85.33 
 
 
304 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  84.67 
 
 
304 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  85 
 
 
327 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  84.56 
 
 
305 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  83.56 
 
 
312 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  82.94 
 
 
313 aa  521  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  81.13 
 
 
314 aa  521  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  76.16 
 
 
302 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  77.52 
 
 
312 aa  490  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  74.16 
 
 
305 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  74.4 
 
 
295 aa  457  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  70.13 
 
 
307 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  70.47 
 
 
302 aa  441  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  61.99 
 
 
290 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  54.61 
 
 
296 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  47.54 
 
 
287 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  47.54 
 
 
287 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  47.22 
 
 
302 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  44.13 
 
 
323 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  45.86 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  38.11 
 
 
294 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  37.81 
 
 
300 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  38.41 
 
 
312 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  37.14 
 
 
275 aa  188  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  37.14 
 
 
289 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  37.14 
 
 
289 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  35.76 
 
 
310 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  38.32 
 
 
286 aa  185  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  35.42 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  35.42 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  35.42 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  36.21 
 
 
312 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  35.19 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  35.52 
 
 
309 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  34.21 
 
 
320 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  34.93 
 
 
304 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  34.49 
 
 
289 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  36.01 
 
 
300 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  36.81 
 
 
296 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  33.68 
 
 
289 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  34.31 
 
 
271 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  34.63 
 
 
296 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  32.63 
 
 
286 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  32.87 
 
 
283 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  36.96 
 
 
274 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  33.94 
 
 
271 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  33.1 
 
 
321 aa  159  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  32.5 
 
 
291 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  34.05 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  33.1 
 
 
295 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
290 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  35.11 
 
 
306 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  33.44 
 
 
295 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  32.64 
 
 
297 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  34.62 
 
 
315 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  32.98 
 
 
289 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  32.75 
 
 
295 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  35.64 
 
 
290 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  32.04 
 
 
286 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  34.16 
 
 
296 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  31.8 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  34.67 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  33.93 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  34.31 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  34.31 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  33.68 
 
 
320 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  31.16 
 
 
272 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  34.01 
 
 
311 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  33.22 
 
 
308 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  30.45 
 
 
287 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  32.31 
 
 
325 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  32.85 
 
 
280 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  31.96 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  31.03 
 
 
277 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  32.48 
 
 
306 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  32.48 
 
 
306 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  33.68 
 
 
284 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  31.96 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  32.62 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  31.75 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  39.88 
 
 
198 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  39.88 
 
 
198 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  30.56 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  34.05 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  28.72 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  32.86 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  33.33 
 
 
302 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  32.27 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  34.98 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  32.33 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  33.19 
 
 
271 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
297 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  30.38 
 
 
330 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  29.14 
 
 
277 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  30.38 
 
 
330 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  30.38 
 
 
330 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  30.38 
 
 
330 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>