142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0697 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0697  amidohydrolase 2  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0708  amidohydrolase 2  95.15 
 
 		 268 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63573e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2276  amidohydrolase 2  70.85 
 
 		 260 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.523292  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2127  hypothetical protein  62.65 
 
 		 253 aa  339  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2101  hypothetical protein  61.85 
 
 		 253 aa  337  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3758  hypothetical protein  64.34 
 
 		 249 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1722  amidohydrolase 2  65.57 
 
 		 248 aa  325  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2022  putative lactonase  54.73 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.244849  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0172  amidohydrolase family protein  55.14 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.222028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0457  amidohydrolase 2  56.91 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1983  amidohydrolase 2  54.32 
 
 		 247 aa  279  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.554072  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2493  amidohydrolase 2  57.48 
 
 		 254 aa  275  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1876  amidohydrolase 2  51.84 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0123209  normal  0.0185409 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  30.15 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  31.64 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  31.64 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  33.61 
 
 		 293 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  32.91 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  29.77 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  31.01 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  33.19 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  33.19 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  32.64 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  32.58 
 
 		 286 aa  98.6  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  30.27 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  32.75 
 
 		 302 aa  95.9  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  35.67 
 
 		 198 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  35.67 
 
 		 198 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  29.39 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  29.39 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  29.39 
 
 		 289 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  32.7 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  30.11 
 
 		 297 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 300 aa  92  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  28.08 
 
 		 291 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  30.94 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  31.39 
 
 		 286 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 307 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  28.4 
 
 		 306 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  31.98 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  28 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  28.95 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  30 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 327 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  29.24 
 
 		 286 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  30.97 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  28.57 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  28.77 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  27.59 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  31.16 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  31.22 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  28.74 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  27.31 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  35.53 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  31.93 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  28.26 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  29.55 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  31.93 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  29.89 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  30.64 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  26.62 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  27.57 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  28.88 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  28.88 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  29.65 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  27.17 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  27.34 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  29.61 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  25.88 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  26.98 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  28.14 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  30.33 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  26.64 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  33.85 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  28.63 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  30.45 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  25.52 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  29.93 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  33.33 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  33.33 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  28 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  33.33 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  33.33 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  33.33 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  25.38 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  29.55 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  25.68 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  27.19 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  26.42 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  29.61 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  26.42 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  26.42 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  26.34 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  24.64 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  26.34 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>