164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1387 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0866  hydrolase  100 
 
 
330 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  98.48 
 
 
368 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  100 
 
 
330 aa  665    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  100 
 
 
330 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  97.88 
 
 
324 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  98.48 
 
 
327 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  100 
 
 
330 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  88.54 
 
 
308 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  62.14 
 
 
296 aa  345  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  52.82 
 
 
297 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  52.03 
 
 
304 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  50.36 
 
 
281 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  51.09 
 
 
303 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  50.74 
 
 
295 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  48.38 
 
 
306 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  48.38 
 
 
306 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  50.56 
 
 
302 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  52.06 
 
 
298 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  44.24 
 
 
280 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  47.64 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  47.27 
 
 
296 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  47.27 
 
 
296 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  47.27 
 
 
296 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  47.27 
 
 
296 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  43.49 
 
 
280 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  46.91 
 
 
295 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  45.96 
 
 
282 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  41.99 
 
 
284 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  44.12 
 
 
277 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  47.12 
 
 
299 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  42.38 
 
 
277 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  45.22 
 
 
291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  37.82 
 
 
274 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  37.88 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0660  hypothetical protein  30.48 
 
 
265 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0270681  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0581  hypothetical protein  30.11 
 
 
265 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  36.03 
 
 
275 aa  149  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  36.03 
 
 
289 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  35.66 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  38.49 
 
 
300 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  36.18 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  36.3 
 
 
266 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  37.73 
 
 
289 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  37.73 
 
 
291 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  36.92 
 
 
295 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3800  amidohydrolase 2  39.76 
 
 
281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  35.51 
 
 
290 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3775  amidohydrolase 2  35.48 
 
 
281 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0945116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  35.42 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  31.62 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  34.18 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  32.29 
 
 
310 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  36.4 
 
 
276 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  33.95 
 
 
296 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  32.28 
 
 
320 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  32.84 
 
 
274 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  34.32 
 
 
294 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  33.46 
 
 
304 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  31.6 
 
 
310 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  31.6 
 
 
310 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  31.25 
 
 
310 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
279 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  34.19 
 
 
312 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  33.7 
 
 
277 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  31.88 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  33.7 
 
 
296 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  32.12 
 
 
312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  31.25 
 
 
320 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  32.1 
 
 
275 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  31.6 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  32.73 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  29.24 
 
 
323 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  32.49 
 
 
289 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  30.37 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  36.1 
 
 
308 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  31.07 
 
 
312 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  34.42 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  32.59 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  36.26 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  32.73 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  32.59 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  34.77 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  31.94 
 
 
325 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  32.97 
 
 
306 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  32.84 
 
 
290 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  35.44 
 
 
311 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  32.59 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  30.04 
 
 
287 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  32.62 
 
 
289 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  32.01 
 
 
286 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  32.14 
 
 
305 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  30.95 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  31.32 
 
 
312 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  36.89 
 
 
271 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  30.38 
 
 
305 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  32.1 
 
 
286 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  31.9 
 
 
302 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
287 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  30.38 
 
 
304 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>