156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0660 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  100 
 
 		 294 aa  597  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  41.46 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  42.8 
 
 		 286 aa  218  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  42.8 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  42.07 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  42.07 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  41.7 
 
 		 289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  38.3 
 
 		 287 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  37.94 
 
 		 287 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  40.36 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  38.6 
 
 		 307 aa  208  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  38.44 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  38.89 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  40.35 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  37.54 
 
 		 302 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  40.43 
 
 		 302 aa  195  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  43.07 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  38.19 
 
 		 289 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  38.72 
 
 		 296 aa  195  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  35.54 
 
 		 323 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  38.11 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  38.83 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  43.07 
 
 		 312 aa  191  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  37.41 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  38.89 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  37.32 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  41.61 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  37.41 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  40.74 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  36.62 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  38.19 
 
 		 295 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  38.49 
 
 		 290 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  36.71 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  39.13 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  36.97 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  36.97 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  34.3 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  36.46 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  37.06 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  37.19 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  36.56 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  37.54 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  37.82 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  36.36 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  40.15 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  40.73 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  37.45 
 
 		 282 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  35.64 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  35.64 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  36.69 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  34.91 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  42.54 
 
 		 274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  41.51 
 
 		 293 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  36.48 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  37.02 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  41.13 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  41.13 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  38.19 
 
 		 320 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  36.46 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  38.2 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  38.97 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  39.35 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  36.7 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  35.53 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  38.11 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  34.26 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  36.52 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  35.87 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  38.01 
 
 		 277 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  38.11 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  35.04 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  39.42 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  38.03 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  35.58 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  32.37 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  37.28 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  36.23 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  33.68 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  35.74 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  35.74 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  35.58 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  34.69 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  35.58 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  34.6 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  34.32 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  34.32 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  34.32 
 
 		 368 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  34.32 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  34.32 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  34.32 
 
 		 324 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  34.32 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  37.5 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  35.42 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  33.09 
 
 		 281 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  36.76 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  36.76 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  37.04 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  36.76 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>