147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1458 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  100 
 
 
287 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  86.06 
 
 
287 aa  524  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  57.66 
 
 
302 aa  302  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  50.54 
 
 
295 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  47.86 
 
 
323 aa  272  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  45.99 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  47.89 
 
 
312 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  49.13 
 
 
305 aa  265  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  47.54 
 
 
302 aa  261  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  46.83 
 
 
312 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  47.39 
 
 
304 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  46.48 
 
 
304 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  46.48 
 
 
327 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  46.69 
 
 
304 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  46.43 
 
 
302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  47.39 
 
 
305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  47.04 
 
 
313 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  45.02 
 
 
314 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  44.41 
 
 
302 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  42.76 
 
 
307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  46.04 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  44.91 
 
 
296 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  41.46 
 
 
291 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  42.48 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  39.08 
 
 
300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  38.3 
 
 
294 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  41.2 
 
 
306 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  40 
 
 
289 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  40 
 
 
275 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  40 
 
 
289 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  40.42 
 
 
289 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  40.07 
 
 
295 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  38.95 
 
 
300 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  36.49 
 
 
289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  38.49 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  39.59 
 
 
295 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  37.59 
 
 
286 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  36.99 
 
 
295 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  36.73 
 
 
310 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  36.73 
 
 
310 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  39.13 
 
 
286 aa  185  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  36.73 
 
 
310 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  36.23 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  36.52 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  38.77 
 
 
309 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  35.51 
 
 
312 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  37.32 
 
 
289 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  33.82 
 
 
283 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  35.77 
 
 
310 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  37.59 
 
 
290 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  35.44 
 
 
297 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
321 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  35.74 
 
 
296 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  36.52 
 
 
296 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  34.81 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  33.95 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  38.79 
 
 
311 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  35.21 
 
 
271 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  34.46 
 
 
271 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  35.44 
 
 
290 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  36.3 
 
 
296 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  36.69 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  38.96 
 
 
315 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  32.21 
 
 
272 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  36.06 
 
 
274 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  35.4 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  31.69 
 
 
325 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  33.7 
 
 
320 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  33.81 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  32.62 
 
 
285 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  34.09 
 
 
293 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  33.71 
 
 
280 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  34.09 
 
 
293 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  34.09 
 
 
293 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  32.85 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  31.72 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  35.19 
 
 
296 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  35.19 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  34.69 
 
 
306 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  34.69 
 
 
306 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  34.81 
 
 
296 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  34.81 
 
 
296 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  34.81 
 
 
296 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  34.81 
 
 
296 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  33.71 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  35.87 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  35.87 
 
 
280 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  33.58 
 
 
276 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  30.58 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  36.43 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
281 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  31.36 
 
 
297 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  33.46 
 
 
291 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  32.22 
 
 
298 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  34.15 
 
 
302 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  34.44 
 
 
282 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  31.85 
 
 
303 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  35.8 
 
 
271 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  34.8 
 
 
299 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  34.41 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>