154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3635 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  100 
 
 		 314 aa  649    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  91.4 
 
 		 312 aa  598  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  88.56 
 
 		 304 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  87.21 
 
 		 304 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  86.56 
 
 		 305 aa  561  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  86.89 
 
 		 304 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  85.44 
 
 		 313 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  85.57 
 
 		 327 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  81.13 
 
 		 302 aa  521  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  77.45 
 
 		 305 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  74.75 
 
 		 302 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  72.58 
 
 		 312 aa  491  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  72.97 
 
 		 295 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  69.84 
 
 		 302 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  70.82 
 
 		 307 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  61.49 
 
 		 290 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  54.58 
 
 		 296 aa  334  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  47.37 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  45.14 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  45.02 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  41.58 
 
 		 323 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  42.33 
 
 		 290 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  38.68 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  38.57 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  35.96 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  35.96 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  35.62 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  36.73 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  36.46 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  35.96 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  36.33 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  35.92 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  35.92 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  35.92 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  34.8 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  36.84 
 
 		 289 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  35.05 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  35.71 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  34.83 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  35.71 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  35 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  35.44 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  32.41 
 
 		 283 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  34.04 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  33.79 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  34.25 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  35.74 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  35.71 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  33.68 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  34.28 
 
 		 282 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  32.3 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  31.35 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  32.64 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  34.71 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  34.15 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  31.6 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  32.14 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  34.81 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  32.06 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  30.59 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  31.14 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  34.64 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  34.64 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  34.29 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  32.46 
 
 		 315 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  32.51 
 
 		 296 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  33.22 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  34.23 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  32.31 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  33.22 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  31.65 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  31.06 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  27.97 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  33.1 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  41.72 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  41.72 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  30.67 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  29.23 
 
 		 277 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  31.53 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  31.53 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  31.45 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  29.63 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  29.66 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  28.78 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  32.18 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  31.36 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  29.33 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  34.27 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  31.82 
 
 		 274 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  31.43 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  29.15 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  27.87 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  28.42 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  31.32 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  25.74 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  30.16 
 
 		 297 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  30.53 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>