151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4566 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  100 
 
 
296 aa  608  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  42.18 
 
 
300 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  41.72 
 
 
289 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  43.17 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  41.38 
 
 
289 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  41.16 
 
 
291 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  41.52 
 
 
295 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  40.48 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  38.91 
 
 
306 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  40.53 
 
 
286 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  37 
 
 
296 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  38.38 
 
 
300 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  37.82 
 
 
294 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  38.52 
 
 
289 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  35.74 
 
 
286 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  38.25 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  35.9 
 
 
289 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  36.05 
 
 
302 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  34.4 
 
 
283 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
313 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  34.87 
 
 
312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  34.03 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  36.14 
 
 
295 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  36.63 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  34.53 
 
 
304 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  35.66 
 
 
286 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  33.55 
 
 
304 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  38.97 
 
 
308 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  34.63 
 
 
302 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  34.53 
 
 
304 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  34.87 
 
 
305 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  36.3 
 
 
287 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
305 aa  158  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
307 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  33.76 
 
 
312 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  34.49 
 
 
325 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  38.24 
 
 
297 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  36.3 
 
 
312 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  34.3 
 
 
327 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  33.55 
 
 
302 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  32.85 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
302 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  34.93 
 
 
309 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  37.12 
 
 
290 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  32.13 
 
 
310 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  32.13 
 
 
310 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  36.7 
 
 
311 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  32.74 
 
 
290 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  32.06 
 
 
314 aa  148  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  31.41 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  34.7 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  35.93 
 
 
304 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  34.81 
 
 
290 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  37.12 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  37.12 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  37.01 
 
 
285 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  36.8 
 
 
298 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  37.73 
 
 
291 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  36.16 
 
 
290 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  34.57 
 
 
274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  34.8 
 
 
303 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  32.46 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  32.36 
 
 
295 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  30.25 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  34.21 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  32.62 
 
 
295 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  31.7 
 
 
271 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  31.39 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  38.06 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  30.8 
 
 
323 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  37.13 
 
 
302 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  33.95 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  33.95 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  33.95 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  33.95 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  33.95 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  33.95 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  33.95 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  34.31 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  36.86 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  32.59 
 
 
284 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  32.75 
 
 
321 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  31.37 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  32.21 
 
 
293 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  32.21 
 
 
293 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  32.2 
 
 
293 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
315 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  31.73 
 
 
280 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  32.72 
 
 
281 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  31.93 
 
 
296 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  38.79 
 
 
304 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  32.95 
 
 
280 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  32.59 
 
 
301 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  35.29 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  29.85 
 
 
277 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>