148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2819 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  100 
 
 
296 aa  605  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  59.17 
 
 
295 aa  346  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  56.31 
 
 
304 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  55.48 
 
 
313 aa  339  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  55.97 
 
 
305 aa  338  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  55.29 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  54.95 
 
 
312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  55.29 
 
 
304 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  54.58 
 
 
314 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  56.01 
 
 
307 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  54.61 
 
 
304 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  54.92 
 
 
290 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  54.61 
 
 
302 aa  328  9e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  54.3 
 
 
312 aa  323  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  53.9 
 
 
302 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  51.88 
 
 
302 aa  322  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  53.24 
 
 
305 aa  320  3e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  48.38 
 
 
302 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  42.52 
 
 
290 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  42.55 
 
 
287 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  44.6 
 
 
323 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  44.91 
 
 
287 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  36.46 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  37.46 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  36.84 
 
 
286 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  39.93 
 
 
290 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  38.32 
 
 
286 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  35.99 
 
 
312 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  35.64 
 
 
310 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  34.36 
 
 
309 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  35.29 
 
 
310 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  35.29 
 
 
310 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  34.77 
 
 
300 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  35.23 
 
 
296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  35.62 
 
 
310 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  33.45 
 
 
304 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  32.99 
 
 
295 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  34.26 
 
 
294 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  33.21 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  33.45 
 
 
291 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  38.6 
 
 
297 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  33.58 
 
 
271 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  34.93 
 
 
321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  35.29 
 
 
289 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  30.66 
 
 
283 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  37.8 
 
 
290 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  31.91 
 
 
289 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  33.93 
 
 
306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  31.56 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
296 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  37.94 
 
 
273 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
274 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  31.41 
 
 
289 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  34.58 
 
 
311 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  31.41 
 
 
275 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  33.45 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  32.42 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  31.41 
 
 
289 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  31.79 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  34.4 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  32.16 
 
 
289 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  31.74 
 
 
325 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  32.34 
 
 
293 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  31.97 
 
 
293 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  31.97 
 
 
293 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  29.29 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  31.47 
 
 
315 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  31.93 
 
 
296 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  28.78 
 
 
272 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  34.89 
 
 
320 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  32.3 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  30.32 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  32.08 
 
 
308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  32.28 
 
 
287 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  32.27 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  28.62 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  27.54 
 
 
274 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  30.94 
 
 
280 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  31.12 
 
 
287 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  29.96 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  35.32 
 
 
290 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
298 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  32.73 
 
 
296 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  32.5 
 
 
266 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  28.06 
 
 
284 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  29.31 
 
 
285 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  30.94 
 
 
301 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  34.34 
 
 
198 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  34.34 
 
 
198 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3800  amidohydrolase 2  35.25 
 
 
281 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  32.61 
 
 
274 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  31.41 
 
 
330 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  31.43 
 
 
368 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  30.43 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  31.41 
 
 
330 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  31.41 
 
 
327 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  31.41 
 
 
330 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>