135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3369 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  100 
 
 
301 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  68.07 
 
 
287 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  45.23 
 
 
287 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  37.69 
 
 
272 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  40.67 
 
 
271 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  41.61 
 
 
274 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  39.55 
 
 
271 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  39.42 
 
 
293 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  39.05 
 
 
293 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  39.05 
 
 
293 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  35.97 
 
 
321 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  37.36 
 
 
312 aa  165  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  37.27 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  37 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  37 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  36.63 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  37.55 
 
 
282 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  36.9 
 
 
309 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  37.23 
 
 
297 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  36.53 
 
 
310 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  34.56 
 
 
312 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  37.59 
 
 
320 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  35.02 
 
 
308 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  34.42 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  33.81 
 
 
296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  34.69 
 
 
286 aa  139  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  35.23 
 
 
302 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  35.71 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  30.07 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  30.07 
 
 
275 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  30.07 
 
 
289 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  32.13 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  34.42 
 
 
290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  30.94 
 
 
300 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  33.94 
 
 
291 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
296 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  30.22 
 
 
280 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  31.29 
 
 
290 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  29.75 
 
 
287 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  31.88 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  30.63 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  33.46 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  28.72 
 
 
302 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  31.73 
 
 
290 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  32.18 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  29.68 
 
 
283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  29.17 
 
 
312 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  30.85 
 
 
290 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  28.52 
 
 
287 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  29.89 
 
 
304 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  30.8 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  29.82 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  31.38 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  28.57 
 
 
289 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  29.47 
 
 
314 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  30.25 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  28.72 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  28.47 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  32.98 
 
 
311 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  31.51 
 
 
325 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  29.86 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  29.66 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  30.72 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  32.41 
 
 
320 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  30 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  31.43 
 
 
296 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  30.69 
 
 
290 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  32.36 
 
 
290 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
304 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  29.41 
 
 
302 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  28.83 
 
 
304 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  28.47 
 
 
312 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  28.36 
 
 
296 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  27.68 
 
 
308 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  28.26 
 
 
275 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  27.68 
 
 
368 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  27.68 
 
 
330 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  29.89 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  27.68 
 
 
330 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  27.68 
 
 
330 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  27.68 
 
 
324 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  27.68 
 
 
330 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  27.68 
 
 
327 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  28.42 
 
 
289 aa  99  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  29.25 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  27.54 
 
 
275 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  28.52 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  28.41 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  28.73 
 
 
306 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  28.73 
 
 
306 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  27.72 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  25.55 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  29.64 
 
 
277 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  29.14 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  30.99 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  30.99 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  27.56 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  23.27 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>