174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3133 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  100 
 
 		 281 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  63.77 
 
 		 284 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  55.43 
 
 		 277 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  55.07 
 
 		 280 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  54.71 
 
 		 280 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  50.36 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  50.36 
 
 		 368 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  50.36 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  50.36 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  50.36 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  50.36 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  50.36 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  49.06 
 
 		 295 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  49.26 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  49.82 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  49.82 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  51.84 
 
 		 302 aa  244  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  46.38 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  49.82 
 
 		 298 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  48.31 
 
 		 296 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  51.37 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  47.99 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  48.88 
 
 		 291 aa  234  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  46.24 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  42.09 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  47.58 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  47.58 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  47.58 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  47.58 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  48.12 
 
 		 295 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  47.58 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  44.77 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  47.06 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  43.15 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0660  hypothetical protein  34.69 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0270681  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0581  hypothetical protein  34.32 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  37.41 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  35.42 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  35.42 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  36.88 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3800  amidohydrolase 2  40.32 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3775  amidohydrolase 2  36.55 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0945116 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  36.13 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  35.69 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  30.94 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  34.16 
 
 		 304 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  35.25 
 
 		 310 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  32.97 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  33.57 
 
 		 291 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  33.81 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  32.74 
 
 		 304 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  33.09 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  34.3 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  33.93 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  34.17 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  33.94 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  32.97 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  37.01 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  35.29 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  32.72 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  34.15 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  32.03 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  33.81 
 
 		 327 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  32.62 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  35.09 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  35 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  32.72 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  32.62 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  30.74 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  39.66 
 
 		 271 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  34.07 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  31.45 
 
 		 314 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  33.7 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  34.3 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  33.94 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  32.48 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  32.27 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  32.04 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  31.91 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  32 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  34.17 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  34.17 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  34.17 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  34.17 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  28.99 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  32.73 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  34.19 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  31.43 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  31 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  31.16 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  29.2 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  32.22 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  31.52 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  31.41 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  30.58 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  31.46 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>