173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2123 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  100 
 
 
275 aa  566  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  100 
 
 
289 aa  567  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  99.27 
 
 
289 aa  564  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  64.62 
 
 
300 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  54.38 
 
 
291 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  55.35 
 
 
295 aa  297  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  52.19 
 
 
289 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  52 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  50.57 
 
 
286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  46.13 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  46.4 
 
 
289 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  43.27 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  43.17 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  42.07 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  42.38 
 
 
306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  40 
 
 
287 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  39.86 
 
 
312 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  39.66 
 
 
320 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  38.66 
 
 
296 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  40.07 
 
 
309 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  38.55 
 
 
310 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  38.55 
 
 
310 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  37.04 
 
 
287 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  37.82 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  38.29 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  38.97 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  37.45 
 
 
310 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
312 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  38.69 
 
 
283 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  35.53 
 
 
323 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  37.86 
 
 
305 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  37.14 
 
 
312 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  36.63 
 
 
302 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  39.05 
 
 
289 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  36.14 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  37.14 
 
 
302 aa  188  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  39.41 
 
 
286 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  37.86 
 
 
304 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  37.59 
 
 
271 aa  185  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  37.14 
 
 
312 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  37.14 
 
 
304 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  39.34 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  36.79 
 
 
304 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  37.73 
 
 
297 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  39.33 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  37.04 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  36.43 
 
 
313 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  34.96 
 
 
272 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  37.14 
 
 
327 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  39.71 
 
 
304 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  35.66 
 
 
290 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  36.47 
 
 
271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  39.34 
 
 
296 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  35.92 
 
 
314 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  40.21 
 
 
320 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  35.61 
 
 
307 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  39.41 
 
 
315 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  37.63 
 
 
273 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  36.1 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  38.54 
 
 
325 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  41.01 
 
 
311 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  37.94 
 
 
290 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  39.85 
 
 
298 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  35.21 
 
 
282 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  34.94 
 
 
290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  37.13 
 
 
303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  37.81 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  38.11 
 
 
293 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  38.11 
 
 
293 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  40.15 
 
 
274 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  37.74 
 
 
293 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  38.6 
 
 
308 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  35.19 
 
 
280 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  35.36 
 
 
295 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  33.83 
 
 
297 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  35.58 
 
 
306 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  35.58 
 
 
306 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  37.41 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  34.55 
 
 
290 aa  153  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  36.3 
 
 
308 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  36.03 
 
 
324 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  36.03 
 
 
327 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  36.03 
 
 
330 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  36.13 
 
 
291 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  36.03 
 
 
368 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  36.03 
 
 
330 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  36.03 
 
 
330 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  36.03 
 
 
330 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  35.77 
 
 
284 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  35.38 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  35.29 
 
 
296 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  35.29 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  35.42 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  35.29 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  35.29 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  35.29 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  34.07 
 
 
287 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  35.19 
 
 
295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  35.45 
 
 
296 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  34.52 
 
 
280 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>