148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5473 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  99.03 
 
 
310 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  90.61 
 
 
310 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  49.02 
 
 
312 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  51.25 
 
 
312 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  48.42 
 
 
309 aa  288  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  52.26 
 
 
282 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  48.47 
 
 
304 aa  278  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  71.93 
 
 
198 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  71.93 
 
 
198 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  47.86 
 
 
296 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  46.28 
 
 
308 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  51.07 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  47.74 
 
 
286 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  47.52 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  45.36 
 
 
315 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  49.31 
 
 
320 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  42.64 
 
 
272 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  44.33 
 
 
321 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  45.49 
 
 
274 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  42.5 
 
 
280 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  43.31 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  44.15 
 
 
271 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  43.4 
 
 
271 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  45.25 
 
 
293 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  45.25 
 
 
293 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  44.87 
 
 
293 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  39.19 
 
 
306 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  41.97 
 
 
273 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  36.52 
 
 
289 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  38.55 
 
 
289 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  38.55 
 
 
289 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  38.55 
 
 
275 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  39.05 
 
 
300 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  41.73 
 
 
302 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  38.97 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  39.42 
 
 
286 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  35.6 
 
 
323 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  38.28 
 
 
295 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  36.11 
 
 
304 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  37.85 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  38.75 
 
 
289 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  38.97 
 
 
305 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  36.81 
 
 
327 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  37.15 
 
 
313 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  38.46 
 
 
287 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  37.93 
 
 
312 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
289 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  35.96 
 
 
314 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  36.52 
 
 
302 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  36.73 
 
 
287 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  35.76 
 
 
305 aa  185  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  35.42 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  35.42 
 
 
304 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  35.52 
 
 
312 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  36.03 
 
 
291 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  35.07 
 
 
304 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  35.64 
 
 
287 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  34.4 
 
 
283 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  34.84 
 
 
307 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  38.49 
 
 
290 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  34.55 
 
 
290 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  35.64 
 
 
294 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  37.54 
 
 
325 aa  176  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
296 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  35.54 
 
 
320 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
295 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  34.32 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  37.04 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  32.35 
 
 
290 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  35.29 
 
 
296 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  35.34 
 
 
290 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  34.19 
 
 
287 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  32.13 
 
 
296 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  34.8 
 
 
290 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  31.37 
 
 
296 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  34.94 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  30.22 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  34.08 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  32.71 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  29.35 
 
 
295 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  31.6 
 
 
330 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  31.87 
 
 
368 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  31.6 
 
 
330 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  31.6 
 
 
330 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  31.87 
 
 
324 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  31.87 
 
 
327 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  31.6 
 
 
330 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  31.34 
 
 
279 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  25.57 
 
 
318 aa  122  6e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  33.96 
 
 
297 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  31.84 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
275 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  30.63 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  30.97 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2022  putative lactonase  31.97 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.244849  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0172  amidohydrolase family protein  33.48 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.222028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  34.17 
 
 
281 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  33.83 
 
 
296 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>