150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3756 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  100 
 
 
296 aa  588  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  41.34 
 
 
306 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  39.79 
 
 
290 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  40.68 
 
 
286 aa  205  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  37.32 
 
 
289 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  37.32 
 
 
289 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  38.66 
 
 
275 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  40.07 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  36.46 
 
 
286 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  41.04 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  38.23 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  38.73 
 
 
287 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  38.72 
 
 
294 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  38.81 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  37.94 
 
 
295 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  36.52 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  37.19 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  40.38 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  37 
 
 
296 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  36.9 
 
 
310 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  35.61 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  36.59 
 
 
289 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  36.03 
 
 
300 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  35.97 
 
 
302 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  34.77 
 
 
327 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  36.81 
 
 
313 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  36.46 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  35.89 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  37.32 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  35.48 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  35.79 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  35.19 
 
 
302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  33.82 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  34.77 
 
 
290 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  36.14 
 
 
304 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  36.49 
 
 
312 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
310 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  35.06 
 
 
310 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  34.69 
 
 
310 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  35.89 
 
 
309 aa  169  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  38.24 
 
 
312 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  35.54 
 
 
312 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  35.54 
 
 
304 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  39.04 
 
 
297 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  34.84 
 
 
305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  34.8 
 
 
283 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
272 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  38.52 
 
 
296 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  37.69 
 
 
271 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  33.68 
 
 
314 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  34.04 
 
 
304 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  32.97 
 
 
321 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  36.13 
 
 
280 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  36.03 
 
 
312 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  36.19 
 
 
271 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  35.42 
 
 
305 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  37 
 
 
273 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  35.38 
 
 
304 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  35.71 
 
 
290 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  35.52 
 
 
325 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  32.48 
 
 
287 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  31.95 
 
 
282 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  34.59 
 
 
274 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  37.11 
 
 
296 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  38.99 
 
 
311 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  35.16 
 
 
315 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  35.45 
 
 
308 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  32.32 
 
 
320 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  34.22 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  31.43 
 
 
295 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  33.84 
 
 
293 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  33.84 
 
 
293 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  40.35 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  36.92 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  36.06 
 
 
298 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  37.18 
 
 
290 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  31.21 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  33.7 
 
 
277 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  37.77 
 
 
295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  34.98 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  35 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  34.07 
 
 
303 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  37.01 
 
 
281 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  34.07 
 
 
306 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  34.07 
 
 
306 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  35.32 
 
 
302 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  33.82 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  33.7 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  33.7 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  33.7 
 
 
327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  33.7 
 
 
330 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  33.7 
 
 
330 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  33.7 
 
 
330 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  33.7 
 
 
330 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  34.98 
 
 
304 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  29.25 
 
 
318 aa  119  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  35.44 
 
 
284 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  29.75 
 
 
295 aa  118  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  35.61 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>