146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001537 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  100 
 
 		 289 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  48.88 
 
 		 286 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  47.2 
 
 		 291 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  45.33 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  44.06 
 
 		 300 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  43.84 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  44.76 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  46.29 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  45.94 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  46.4 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  43.06 
 
 		 300 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  41.46 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  40.43 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  40.58 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  39.57 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  40.29 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  36.52 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  36.52 
 
 		 310 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  36.52 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  36.33 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  36.49 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  39.86 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  36.43 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  38.89 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  39.86 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  38.66 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  36.14 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  42.11 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  42.48 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  42.48 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  41.64 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  37.46 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  38.27 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  37.72 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  36.21 
 
 		 290 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  38.93 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  34.28 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  37.59 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  36.52 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  36.01 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  37.31 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  38.52 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  36.81 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  37.01 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  36.36 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  35.19 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  37.36 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  37.1 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  35.79 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  35.19 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  35.05 
 
 		 314 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  37.31 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  38.46 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  38.63 
 
 		 302 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  35.54 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  34.84 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  34.86 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  37.31 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  36.1 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  38.79 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  33.8 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  34.49 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  35.34 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  34.84 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  32.63 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  38.6 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  36.18 
 
 		 320 aa  158  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  34.48 
 
 		 295 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  35.64 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  35.4 
 
 		 298 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  35.27 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  38.15 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  31.47 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  31.91 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  36.43 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  35.25 
 
 		 284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  32.97 
 
 		 315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  37.61 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  35.27 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  32.49 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  35.27 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  34.15 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  35.27 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  34.55 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  34.55 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  34.55 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  34.67 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  34.55 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  36.13 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  31.87 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  31.87 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  32.97 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  35.19 
 
 		 276 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  37.94 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  31.05 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  32.41 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>