187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3940 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  100 
 
 
290 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  65.05 
 
 
295 aa  394  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  64.04 
 
 
312 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  64.04 
 
 
305 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  63.01 
 
 
304 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  63.01 
 
 
327 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  63.36 
 
 
304 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  62.33 
 
 
313 aa  381  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  61.59 
 
 
302 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  61.49 
 
 
314 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  62.67 
 
 
304 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  61.99 
 
 
302 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  60.62 
 
 
305 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  61.99 
 
 
302 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  58.9 
 
 
307 aa  358  4e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  58.5 
 
 
312 aa  358  4e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  54.92 
 
 
296 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  45.99 
 
 
287 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  45.99 
 
 
287 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  43.1 
 
 
323 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  46.59 
 
 
302 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  45.94 
 
 
290 aa  244  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  36.92 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  35.87 
 
 
283 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  35.25 
 
 
320 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  34.3 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  36.96 
 
 
312 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  36.96 
 
 
312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  37.22 
 
 
286 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  35.61 
 
 
296 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  35.66 
 
 
275 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  35.66 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  35.27 
 
 
310 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  36.21 
 
 
289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  35.66 
 
 
289 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  35.56 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  34.88 
 
 
286 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  34.55 
 
 
310 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  34.55 
 
 
310 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  34.18 
 
 
310 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  34.51 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  32.42 
 
 
295 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  35.46 
 
 
306 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  34.27 
 
 
297 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  34.05 
 
 
289 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  34.77 
 
 
300 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  34.29 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  34.3 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  33.1 
 
 
304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  35.36 
 
 
296 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  35.21 
 
 
272 aa  161  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  31.27 
 
 
295 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  32.76 
 
 
321 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  34.77 
 
 
274 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  33.81 
 
 
282 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  32.86 
 
 
295 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  32.21 
 
 
271 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  31.96 
 
 
296 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  32.74 
 
 
296 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  31.84 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  30.82 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
287 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  34.94 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  30.39 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  33.93 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  34.94 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  34.94 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  33.56 
 
 
290 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  30.91 
 
 
273 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  31.71 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  31.62 
 
 
280 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  30.24 
 
 
311 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  30.63 
 
 
277 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  31.1 
 
 
315 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  31.09 
 
 
280 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  31.62 
 
 
280 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  29.7 
 
 
295 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  32.03 
 
 
281 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  31.69 
 
 
284 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  30.51 
 
 
277 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  31.72 
 
 
296 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  42.04 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  30.34 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  30.34 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  42.04 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  34.68 
 
 
304 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  31.97 
 
 
291 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  29.82 
 
 
303 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  28.87 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  30.63 
 
 
368 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  31.02 
 
 
308 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  30.63 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  30.63 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  30.37 
 
 
330 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  30.37 
 
 
330 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  30.37 
 
 
330 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  30.63 
 
 
301 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  30.37 
 
 
330 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>