146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4279 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  100 
 
 
311 aa  614  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  47.2 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  45.8 
 
 
312 aa  252  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  46.15 
 
 
309 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  48.89 
 
 
282 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  47.19 
 
 
296 aa  245  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  47.04 
 
 
304 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  44.44 
 
 
321 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  48.44 
 
 
320 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  43.31 
 
 
310 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  43.31 
 
 
310 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  43.31 
 
 
310 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  48.63 
 
 
308 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  43.86 
 
 
310 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  44.41 
 
 
290 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  42.81 
 
 
315 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  41.72 
 
 
297 aa  205  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  39.1 
 
 
286 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  40.52 
 
 
272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  40.37 
 
 
271 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  39.22 
 
 
306 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  39.31 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  41.9 
 
 
293 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  40.91 
 
 
293 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  40.91 
 
 
293 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  39.79 
 
 
289 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  40.37 
 
 
271 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  42.28 
 
 
274 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  44.29 
 
 
302 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  39.71 
 
 
286 aa  178  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  38.79 
 
 
289 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  37.99 
 
 
287 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  41.64 
 
 
273 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  41.01 
 
 
289 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  41.01 
 
 
275 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  38.79 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  40.65 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  36.9 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  39.73 
 
 
325 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  52.47 
 
 
198 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  52.47 
 
 
198 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
283 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  38.28 
 
 
290 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  37.5 
 
 
290 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  39.16 
 
 
300 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  35.46 
 
 
287 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  37.64 
 
 
280 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  36.7 
 
 
296 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  38.03 
 
 
294 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  36.64 
 
 
295 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  38.99 
 
 
296 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  35.27 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  34.52 
 
 
290 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  38.41 
 
 
305 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  34.92 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  35.57 
 
 
305 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  35.59 
 
 
327 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  34.6 
 
 
307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  39.86 
 
 
289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  33.56 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  34.58 
 
 
304 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  34.12 
 
 
314 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  39.15 
 
 
300 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  38.52 
 
 
291 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  35.07 
 
 
302 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  34.83 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  34.25 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  34.69 
 
 
296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  34.56 
 
 
313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  37.5 
 
 
318 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  31.01 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  37.41 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  39.42 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  36.3 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  30.24 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  34.49 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  32.29 
 
 
302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  36.03 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  36.36 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  32.27 
 
 
287 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  35.66 
 
 
296 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  27.1 
 
 
318 aa  122  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  35.44 
 
 
330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  35.44 
 
 
368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  35.44 
 
 
330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  35.44 
 
 
330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  35.44 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  35.44 
 
 
327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  35.44 
 
 
330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  37.14 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  36.65 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  36.17 
 
 
308 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  36.33 
 
 
280 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  36.42 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  38.49 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  34.89 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  39.33 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  32.85 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  35.71 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2714  putative 2-pyrone-4,6-dicarbaxylate hydrolase  50 
 
 
167 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>