172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2260 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  100 
 
 		 289 aa  597  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  99.31 
 
 		 289 aa  594  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  99.27 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  62.81 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  54.01 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  54.98 
 
 		 295 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  51.23 
 
 		 289 aa  291  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  50.34 
 
 		 300 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  50.57 
 
 		 286 aa  251  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  44.83 
 
 		 290 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  45.94 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  43.27 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  41.38 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  41.7 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  42.01 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  40 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  39.49 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  39.02 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  37.32 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  38.55 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  38.55 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  39.71 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  37.04 
 
 		 287 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  38.41 
 
 		 286 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  37.82 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  38.97 
 
 		 295 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  37.45 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  37.13 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  38.32 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  35.53 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  37.14 
 
 		 312 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  37.86 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  39.86 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  36.63 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  36.14 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  37.14 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  39.03 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  37.86 
 
 		 304 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  37.14 
 
 		 312 aa  185  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  37.22 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  37.14 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  38.6 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  36.79 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  37.36 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  37.04 
 
 		 290 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  38.95 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  36.43 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  34.59 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  37.14 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  39.35 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  35.66 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  38.97 
 
 		 296 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  36.09 
 
 		 271 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  39.72 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  35.92 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  35.97 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  39.03 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  37.28 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  35.48 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  38.19 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  40.65 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  37.59 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  39.47 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  34.83 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  36.76 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  34.57 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  37.46 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  37.74 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  37.74 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  39.78 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  37.78 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  37.36 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  34.81 
 
 		 280 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  35 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  34.46 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  34.46 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  37.05 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  34.18 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  35.93 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  35.66 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  35.77 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  35.66 
 
 		 368 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  35.66 
 
 		 327 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  35.66 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  35.4 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  35.66 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  35.66 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  35.66 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  33.69 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  35.02 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  34.93 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  34.93 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  34.93 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  34.93 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  34.93 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  35.06 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  34.81 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  35.69 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  34.16 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>