190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4044 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  100 
 
 		 306 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  100 
 
 		 306 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  80.98 
 
 		 302 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  59.42 
 
 		 282 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  61.4 
 
 		 296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  60.66 
 
 		 296 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  60.66 
 
 		 296 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  60.66 
 
 		 296 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  60.66 
 
 		 296 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  60.66 
 
 		 295 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  53.14 
 
 		 303 aa  299  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  59.48 
 
 		 298 aa  298  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  60.36 
 
 		 299 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  57.41 
 
 		 291 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  49.45 
 
 		 284 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  48.75 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  48.38 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  48.38 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  48.38 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  48.38 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  53.01 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  48.38 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  48.38 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  48.38 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  50.37 
 
 		 280 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  49.82 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  49.63 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  48.7 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  54.14 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  49.82 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  48.88 
 
 		 277 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  44 
 
 		 274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  45.15 
 
 		 277 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  45.04 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0660  hypothetical protein  34.32 
 
 		 265 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0270681  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0581  hypothetical protein  34.32 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  41.64 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  38.69 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  34.83 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  35.58 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  34.46 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  36.67 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  36.94 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  38.75 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  37.37 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  37.87 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3775  amidohydrolase 2  36.33 
 
 		 281 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0945116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  38.29 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3800  amidohydrolase 2  42.45 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  37.12 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  38.75 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  35.79 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  35.74 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  34.69 
 
 		 287 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  32.46 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  31.87 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  32.34 
 
 		 279 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  35.45 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  33.09 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  36.3 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  30.94 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  34.07 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  30.74 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  32.48 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  30.66 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  33.22 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  33.46 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  40 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  31.75 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  30.51 
 
 		 272 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  32.25 
 
 		 304 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  30.34 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  32.59 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  30.6 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  31.23 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  32.85 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  34.18 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  34.2 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  32.61 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  32.48 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  31.53 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  32 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  31.96 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  34.43 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  32 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  35.77 
 
 		 296 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  31.09 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  29.37 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  33.69 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  31.5 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  31.48 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  31.48 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  31.85 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  33.21 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  31.09 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  31.31 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  31.37 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  31.48 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>