145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3895 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  100 
 
 		 297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  60.95 
 
 		 273 aa  318  7e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  51.39 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  51.39 
 
 		 321 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  46.5 
 
 		 304 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  47.16 
 
 		 312 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  47.16 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  48.41 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  47.37 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  47.52 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  47.52 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  46.45 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  46.81 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  48.23 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  47.92 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  46.88 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  40.89 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  44.07 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  43.88 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  41.08 
 
 		 311 aa  198  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  43.17 
 
 		 293 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  43.17 
 
 		 293 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  42.38 
 
 		 280 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  40.15 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  39.78 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  38.04 
 
 		 287 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  41.33 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  42.18 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  39.07 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  41.39 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  37.73 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  37.73 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  37.36 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  34.74 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  37.01 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  36.69 
 
 		 294 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  37.32 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  36.84 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  35.44 
 
 		 287 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  38.93 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  37.33 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  37.76 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  38.13 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  36.01 
 
 		 320 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  34.75 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  34.27 
 
 		 290 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  39.04 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  38.77 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  35.07 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  35.34 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  37.37 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  37.37 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  34.38 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  35.52 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 302 aa  161  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  37.85 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  34.46 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  34.58 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  35.36 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  34.93 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  37.24 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  35.07 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  34.9 
 
 		 325 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  38.24 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  33.9 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  36.52 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  32.27 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  37.36 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  34.38 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  32.64 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  38.6 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  32.28 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  33.67 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  35.15 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  33.22 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  34.94 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  42.19 
 
 		 198 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  42.19 
 
 		 198 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  36.19 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  35.84 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  34.42 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  33.82 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  33.94 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  36.3 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  33.1 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  33.22 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  33.22 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  33.1 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  33.1 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  32.86 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  32.86 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  32.86 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  32.86 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  34.53 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  34.78 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  35.84 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  30.92 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  37.25 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  35.25 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  32.35 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>