135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5930 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  71.86 
 
 		 295 aa  444  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  73.9 
 
 		 296 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  39.59 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  38.23 
 
 		 287 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  39.01 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  36.73 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  35.62 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  36.3 
 
 		 290 aa  169  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  34.88 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  33.67 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  34 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  31.27 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  33.45 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  33.44 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  33 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  33 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  36.04 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  34.75 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  33 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  35.94 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  34.81 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  33 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  35.29 
 
 		 291 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  34.3 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  32.78 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  32.89 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  32.78 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  33.44 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  36.96 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  32.99 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  31.53 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  30.59 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  35.38 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  35.38 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  33.09 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  34.14 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  35.02 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  34.17 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  33.09 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  31.47 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  33.67 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  35.17 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  34.15 
 
 		 296 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  33.56 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  32.62 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  34.04 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  33.9 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  35.64 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  35.64 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  31.14 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  36 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  32.3 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  31.43 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  32.5 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  34.78 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  33.68 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  32.65 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  31.94 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  32.62 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  31.54 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  29.97 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  31.65 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  31.77 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  29.71 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  33.21 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 285 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  33.94 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  29.35 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  29.35 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  34.49 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  32.41 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  30.48 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  32.38 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  32.27 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  31.41 
 
 		 276 aa  99.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  30.22 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  31.77 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  33.57 
 
 		 274 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  30.07 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  29.39 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  31.4 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  28.17 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  26.5 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  28.11 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  28.11 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  29.6 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  28.83 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  29.24 
 
 		 275 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  27.34 
 
 		 280 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  27.8 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  26.03 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 281 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  29.64 
 
 		 368 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  28.63 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  29.64 
 
 		 327 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  27.34 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  29.64 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>